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“智慧芽旗下Bio生物序列資料庫于2024年3月21日重磅推出全球首個序列的化學修飾檢索功能，在生物資訊學領域再次樹立了新的裡程碑。”
來源：IPRdaily中文網（iprdaily.cn）
作為全球領先的生物資料資源，智慧芽旗下Bio生物序列資料庫（簡稱"Bio")在生物資訊學領域再次樹立了新的裡程碑--于2024年3月21日重磅推出全球首個序列的化學修飾檢索功能。這是暨2023年創新後再一次創新突破，Bio以其卓越的功能和深度的資料覆寫，不僅在行業内确立了無可匹敵的競争優勢，更被公認為業界的領航者！
Bio生物序列資料庫化學修飾檢索功能正式上線！
基礎概念——什麼是化學修飾？
序列的化學修飾是指對核酸（DNA、RNA）或蛋白質等生物大分子結構的改變。這些修飾涉及在序列中的特定位點引入化學基團或做其他結構變化，進而改善它們的特性或功能。例如2'-氧甲基（2'-OMe）修飾：在siRNA的核苷酸中，2'-羟基被甲基基團取代，這種修飾可以提高siRNA的穩定性，增強對RNA酶的抵抗力。類似的還有磷酸二酯（phosphorothioate）修飾、膽固醇修飾（5’-Chol，3’-Chol）等等。化學修飾方式可以根據經驗、專利文獻結合具體的實驗需求和應用場景進行選擇群組合，以提高目标産品性能，改善治療效果。
為什麼做序列化學修飾檢索資料庫？
随着小核酸多肽賽道的熱度飙升，序列的設計和修飾是開發這些領域有效藥物的關鍵步驟，同時也是IP保護的重要政策點。然而，目前全球尚無資料庫能夠通過修飾類型和修飾位點實作一鍵式檢索，覆寫所有相關序列和專利，導緻專業人員不得不依賴耗時的關鍵詞搜尋和專家篩選。
智慧芽Bio産研團隊通過對國際制藥企業的深入調研揭示了一個現實挑戰：在缺少高效自動化工具的背景下，研發與IP專業人員不得不依賴初步目标設定和手動檢索專利資訊的政策，且需頻繁更新。專利檔案中對化學修飾的隐晦描述進一步增加了這一過程的複雜性，顯著提升了侵權風險管理的難度。
調研結果凸顯了化學修飾序列檢索在以下兩大關鍵領域的緊迫性和重要性：
1）研發效率提升：有效的化學修飾檢索工具能夠助力研發團隊精确識别和分析目标蛋白的修飾狀态，進而加速藥物發現和分子設計的過程，提升研發效率和成果的轉化潛力。
靶辨別别：對于專注于信号傳導機制的研發團隊，通過檢索具有特定化學修飾（如磷酸化）的序列，能夠精确識别并鎖定潛在的靶标蛋白，進而加速藥物發現過程。
藥物優化：研發人員通過分析不同化學修飾對分子的半衰期和穩定性的影響，可以優化藥物候選物的性能，以期達到更高的療效和安全性标準。
2）IP戰略保護：對化學修飾的深入了解和快速檢索對于IP專業人員至關重要，有助于在激烈的市場競争中維護其知識産權優勢，規避潛在的法律風險。
可專利性分析：IP團隊通過細緻梳理現有文獻和專利資料，評估特定化學修飾的新穎性。通過比較目标修飾與已知修飾，他們能夠識别出可能支援專利申請的獨特特征。
FTO評估：IP專家需對現有知識産權進行全面審查，以确定新發現的化學修飾是否可能侵犯他人的專利權。這包括分析特定修飾的使用情況、相關文獻記錄等，以確定研發活動不會引發知識産權糾紛。
推出全球首創功能，使用者可高效檢索序列的化學修飾
使用者以前隻能按序列檢視化學修飾，現在使用智慧芽Bio化學修飾檢索功能可直接通過化學修飾檢索序列和專利，無需再手動整理。傳統費時費力的化學修飾檢索難題，在智慧芽Bio化學修飾檢索功能裡均得到解決。
圖：Bio生物序列資料庫化學修飾檢索入口
傳統挑戰1：專利文獻中對序列修飾的描述缺乏統一标準，導緻差異巨大。使用者在進行關鍵詞搜尋時，必須手動包含所有可能的修飾，這極易導緻關鍵專利的遺漏。
Bio的技術突破：我們已成功為衆多序列修飾建立了标準化的檢索體系，并将持續進行疊代優化，以確定使用者能夠準确、全面地擷取所需資訊。
圖：支援标準化化學修飾體系勾選
傳統挑戰2：使用者在搜尋具有相同修飾類型的序列，尤其是特定位點的序列時，面臨極大的困難。現有的工作流程複雜，通常需要結合基礎序列搜尋和修飾類型關鍵詞搜尋，采取多政策并行的方法。
Bio的技術突破：通過我們的化學修飾檢索功能，使用者可無需序列資訊即可直接搜尋特定修飾類型的序列，極大地簡化了檢索流程，提高了檢索的精确度和效率。
圖：無序搜尋更深洞察研發思路
傳統挑戰3：無法直覺顯示整個化學修飾檢索結果。單獨看每篇專利中的化學修飾可能會遺漏一些關鍵資訊，比如常見的修飾類型、最優的修飾位點或該領域的熱門研發趨勢。
Bio的技術突破：我們的清單頁"修飾總覽"可讓使用者快速識别整個資料結果中化學修飾的分布，并支援導出報告。
圖：“修飾總覽”一覽修飾全貌
創新突破背後的資料、技術及産品詳細展示
化學修飾資料來源
基于智慧芽資料專家團隊人工整理67萬資料，以及提取專利序列清單中的84萬化學修飾資料，共計150萬修飾序列供使用者搜尋查詢，打造了涵蓋9大類别、382個子類的化學修飾标準化體系。
引入全局序列比對算法
先進的全局比對算法，适用于大部分具有顯著相似性的序列，有時會傳回更好的結果，尤其适用于短序列檢索。
産品便捷好用
檢索界面清晰易用，功能齊全，檢索結果資料全面詳細，可支援導出報告，可追溯命中修飾資料的來源。以下是産品展示。
a. 建構檢索式
b. 檢索結果頁
c. 修飾總覽生成修飾檢索報告
d. 檢視序列詳情
未來持續不斷優化疊代
1. 提升化學修飾标準化的準确性和覆寫度，使用者可對更多的特定修飾進行精确檢索。
2. 擴大專利中修飾覆寫的範圍，涵蓋表格、全文、圖檔，進一步更好地支援使用者檢索修飾序列。
3. 提升結果的可視化展示，提供直覺的資料解讀方式，清晰地識别不同資料之間的關系。
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（原标題：行業革新！繼「通式檢索」後，全球獨家「化學修飾檢索」技術震撼登場）
來源：IPRdaily中文網（iprdaily.cn）
編輯：IPRdaily辛夷 校對：IPRdaily縱橫君