DNA序列

輸入m個長度為n的DNA序列，求一個DNA序列，到所有序列的總的Hamming距離盡量小，兩個等長字元串的Hamming距離等于字元不同的位置個數，例如，ACGT和GCGA的Hamming距離為2（左數第1，4個字元不同）。

輸入整數m和n（4<=m<=50,4<=n<=1000）,以及m個長度為m的DNA序列（隻包含字母A,C,G,T），輸出到m個序列的Hamming距離和最小的DNA序列和對應的距離。如有多解，要求為字典序最小的解。例如，對于下面5個DNA序列，最優解為TAAGCTAC。

TATGATAC

TAAGCTAC

AAAGATCC

TGAGATAC

TAAGATGT

#include<stdio.h>
#include<string.h>
//數組太大，定義在主函數外面可以防止程式異常退出
int a[55][55];
int main() {
    int n,m;
    char s[55][1005];
    memset(a,0,sizeof(a));
    scanf("%d%d",&n,&m);
    for(int i = 1;i <= n;i++){
        scanf("%s",s[i]);
    }
    //計算Hamming值，
    for(int i = 1;i <= n;i++){
        for(int j = 1;j <= n;j++){
            //j<i時，可以直接取行列互換的後數組的值，
            //（比如1和3比 and 3和1比是一個結果）這樣可以達到優化的目的
            if(j < i){
                a[i][j] = a[j][i];
            }else if(j > i){
                for(int k = 0;s[i][k] != '\0';k++){
                    if(s[i][k] != s[j][k]) a[i][j]++;
                }
            }
        }
    }
    //統計Hamming
    for(int i = 1;i <= n;i++)
        for(int j = 1;j <= n;j++)
            a[i][n+1] += a[i][j];
    //找到Hamming最小值的那個DNA序列
    int min = 1;
    for(int i = 2;i <= n;i++){
        if(a[i][n+1] < a[min][n+1]){//值小則替換更新
            min = i;
        }else if(a[i][n+1] == a[min][n+1]){//如果值相等則取字典序小的
            if(strcmp(s[i],s[min]) < 0) min = i;
        }
    }
    //輸出結果
    printf("%s\n",s[min]);
    return 0;
}