Protel99SE是應用于Windows9X/2000/NT作業系統下的EDA設計軟體，采用設計庫管理模式，可以進行聯網設計，具有很強的資料交換能力和開放性及3D模拟功能，是一個32位的設計軟體，可以完成電路原理圖設計，印制電路闆設計和可程式設計邏輯器件設計等工作，可以設計32個信号層，16個電源–地層和16個機加工層
Protel99se主要包含以下倆大部分和6個功能子產品。
電路工程設計部分
(1)電路原理設計部分（Advanced Schematic 99）：電路原理圖設計部分包括電路圖編輯器（簡稱SCH編輯器）、電路圖零件庫編輯器（簡稱Schlib編輯器）和各種文本編輯器。本系統的主要功能是：繪制、修改和編輯電路原理圖；更新和修改電路圖零件庫；檢視和編輯有關電路圖和零件庫的各種報表。
（2）印刷電路闆設計系統（Advanced PCB 99）：印刷電路闆設計系統包括印刷電路闆編輯器（簡稱PCB編輯器）、零件封裝編輯器（簡稱PCBLib編輯器）和電路闆元件管理器。本系統的主要功能是：繪制、修改和編輯電路闆；更新和修改零件封裝；管理電路闆元件。
（3）自動布線系統（Advanced Route 99）：本系統包含一個基于形狀（Shape-based）的無栅格自動布線器，用于印刷電路闆的自動布線，以實作PCB設計的自動化。
電路仿真與PLD部分
（1）電路模拟仿真系統（Advanced SIM 99）：電路模拟仿真系統包含一個數字/模拟信号仿真器，可提供連續的數字信号和模拟信号，以便對電路原理圖進行信号模拟仿真，進而驗證其正确性和可行性。
（2）可程式設計邏輯設計系統（Advanced PLD 99）：可程式設計邏輯設計系統包含一個有文法功能的文本編輯器和一個波形編輯器（Waveform）。本系統的主要功能是；對邏輯電路進行分析、綜合；觀察信号的波形。利用PLD系統可以最大限度的精簡邏輯部件，使數字電路設計達到最簡化。
（3）進階信号完整性分析系統（Advanced Integrity 99）：信号完整性分析系統提供了一個精确的信号完整性模拟器，可用來分析PCB設計、檢查電路設計參數、實驗超調量、阻抗和信号諧波要求等。