本節所給的時序圖主要表示總線以32位方式執行有關操作時，相應信号之間的關系。在具體圖示中，當以信号以虛線畫出時，則表示沒有裝置驅動它，但若此虛線處在基準位置時，仍然可表示它具有一個穩定的值；當三态信号以虛線方式畫在高、低狀态之間時，說明它的值是不穩定的（例如，AD線或C/BE#線）；當一條實線程式設計連續的短線時，表明它由原來的被驅動狀态變成了現在的三态；當一實線在由低向高跳變後變為連續的短線時，則說明該信号先經預充電變為高電平，然後變成三态（釋放）。上述關于信号狀态畫法的約定在以後的章節中同樣适用。
4.1、總線上的讀操作
下圖表示了總線上一次讀操作中有關信号的變化情況。
從圖中可以看出，一旦FRAME#信号有效，位址期就開始，并在時鐘2的上升沿處穩定有效。在位址期内，AD[31..0]上包含有有效位址，C/BE[3..0]上含有一個有效的總線指令。資料期時從時鐘3的上升沿處開始的，在此期間，AD[31..0]線上傳送的時資料，而C/BE#線上的資訊卻指出資料線上的哪些位元組是有效的（即哪幾個位元組時目前要傳輸的）。要特别指出的是無論是讀操作還是後邊講的寫操作，從資料期的開始一直到傳輸的完成，C/BE#的輸出緩沖器必須始終保持有效狀态。
圖中的DEVSEL#信号和TRDY#信号是由被位址期内所發位址選中的裝置（從裝置）提供的，但要保證TRDY#在DEVSEL#之後出現。而IRDY#信号是發起讀操作的裝置（主裝置）根據總線的占用情況自動發出的。資料的真正傳輸是在IRDY#和TRDY#同時有效的時鐘前沿進行的，這兩個信号的其中之一無效時，就表示需插入等待周期，此時不進行資料傳輸。這說明，一個資料期可以包含一次資料傳輸和若幹個等待周期。在上圖中，時鐘4、6、8各進行了一次資料傳輸，而在時鐘3、5、7處插入了等待周期。
在讀操作中的位址期和資料期之間，AD線上要有一個交換周期，這需要由從裝置利用TRDY#強制實作（也就是TRDY#的發出必須比位址的穩定有效慢一拍）。但在交換期過後并且有DEVSEL#信号時，從裝置必須驅動AD線。
在時鐘7處盡管是最後一個資料期，但由于主裝置因某種原因不能完成最後一次傳輸（具體表現是此時IRDY#無效），故FRAME#不能撤銷，隻有在時鐘8處，IRDY#變為有效後，FRAME#信号才能撤銷。
3、總線上的寫操作
下圖表示總線上一次寫操作的時序關系。
由上圖可知，總線上的寫操作與讀操作類似，也是FRAME#信号的有效預示着位址周期的開始，且在時鐘2的上升沿處達到穩定有效。整個資料期也與讀操作基本相同，可以自行分析。隻是在第三個資料期中由從裝置連續插入了三個等待周期，時鐘5處傳輸雙方均插入了等待周期。
值得注意的是，當FRAME#撤銷時必須要有IRDY#發出位前提，以表明時最後一個資料期。另外，從上圖可看出，主裝置在是時鐘5處因撤銷了IRDY#而插入等待周期，表明要寫的資料将延遲發送，但此時，位元組使能信号不受等待周期的影響，不得延遲發送。
要說寫操作與讀操作的不同點，那就是在寫操作中，位址期與資料期之間沒有交換周期，這是因為，在此類操作中，資料和位址是由同一個裝置（主裝置）發出的。
最後強調的是：上述的讀/寫操作均以多個資料期為例來說明的。如果是一個資料期時，FRAME#信号在沒有等待周期的情況下，應在位址期（讀操作應在交換周期）過後即撤銷。若由等待周期時，請自行分析其時序關系。
3.3、傳輸的終止過程
無論是主裝置還是從裝置，都可以提出終止一次PCI總線傳輸的要求，但要求不等于具體實施，也就是說雙方均無權力單方面實施傳輸停止工作，需要互相配合，這一點可從下面的叙述中體會到。不過有一點是肯定的，那就是傳輸的最終停止控制要由主裝置完成，這是因為傳輸的結束必須滿足系統的要求并且應是有秩序的，這隻有主裝置才能做到。同時，所有傳輸的結束标志是FRAME#信号和IRDY#信号均已撤銷而進入總線空閑狀态。
1、由主裝置提出的終止
主裝置是通過撤銷FRAME#信号并建立IRDY#信号來提出終止請求的。實際上，這樣做的目的就是告訴從裝置，現在已進入了最後的資料期，此後IRDY#一直保持有效，直到出現TRDY#信号，完成最後一個資料的傳輸。接着IRDY#便撤銷，進而達到完全終止的條件（FRAME#和IRDY#同時無效），結束傳輸，進入總線的空閑狀态。
主裝置一般在什麼情況下會提出終止傳輸的要求呢，其原因有二：
1）這是一個最常見，也是一個最容易了解的原因，它就是主裝置已做完要做的事。
2）當主裝置的GNT#信号無效并且内部的延時計數器已滿，進而不得不終止傳輸，即所謂的逾時。究其逾時的原因，不是從裝置産生的通路延遲，便是要做的操作太久。
下面通過例子來進一步說明上述兩種終止傳輸的具體情形。
如下圖所示，在時鐘3處，主裝置撤銷了FRAME#信号而建立了IRDY#，說明它已得知目前的操作已完成，便以此方式提出終止，而此時TRDY#也正好有效，故最後一個資料被傳輸，而當時鐘4到來時，IRDY#已撤銷，因為此時傳輸已經完成，是以IRDY#也在此刻失效。但實際上在時鐘3處，TRDY#也可以無效，進而形成最終資料傳輸及終止的延遲，應注意的事此時應保證主裝置發出的IRDY#的有效期維持到最終資料傳輸完成為止。
在上圖中，也可認為是因逾時而引起的傳輸終止。在這種情況下，FRAME#在時鐘3處的無效就應看成是由于計時器已滿而造成的。此時GNT#撤銷并且主裝置已準備好最終資料傳輸（因IRDY#有效），但因GNT#無效，不允許使用總線，應該終止，（不過，若使用的是存儲器寫并無效指令，則可繼續使用總線，因該指令引起的傳輸不受延時計數器的限制，并且這種傳輸隻有在一個Cache行的邊界上才能停止進行傳輸）其終止的具體過程與第一種方式一樣。如果TRDY#在時鐘2處無效，則終止便後延，最後資料期也要後延，直到TRDY#有效為止。值得注意的是在這種情況下，不一定要做完原來進行的傳輸。
2、由從裝置提出的終止
如果從裝置希望終止一次傳輸，就應向主裝置發出STOP#信号以示請求。隻要STOP#信号一有效，就必須保持到FRAME#信号撤銷為止。在此器件，IRDY#和TRDY#間的關系與STOP#和FRAME#間的關系是互相獨立的，也就是說，在目标裝置要求總之傳輸的操作中，資料的傳輸可有可無，具體情況取決于當時IRDY#和TRDY#的狀态，但有一點應說明：當從裝置發出STOP#信号同時又使TRDY#無效時，則表明從裝置将不再傳輸任何資料，這也意味着，主裝置在此時不必等待最後一次的資料傳輸，而使整個操作結束。
從裝置之是以要求終止目前的傳輸操作，可能基于以下兩種理由：
1）由于死鎖，某些非PCI資源處于非空閑狀态及該裝置處于互斥通路的鎖定狀态等原因，使得目前從裝置無法進行正常的傳輸，不得不要求終止相應的傳輸操作。也就是說，從裝置目前尚無資料傳輸。通常把這種情況也稱為再試。
2）此種情況下的終止，通常也稱為斷開。使由于從裝置在八個時鐘周期内不能對主裝置作出響應，因而隻要要求停止傳輸。但斷開往往不會發生在第一個資料期，也就是說，一般在進行了一些資料傳輸之後才會發生。
對于大多數從裝置都要求能實作再試功能，而其它終止方式可作為選項。對于哪些不支援互斥通路、不能檢測思索條件、不會陷入需要它們拒絕的一個通路之中的裝置，也可将再試作為選項。但對于主裝置要能夠處理從裝置以任何方式提出的終止請求。
再試方式較為容易，下面舉例再對斷開方式作進一步的說明。
如上圖所示，由于從裝置再發出STOP#信号時，同時使TRDY#有效，進而表明它還要進行一次資料傳輸才終止。從圖中可以看出，在時鐘2處STOP#已穩定有效，是以接下來主裝置就将FRAME#撤銷并建立TRDY#，表示接受了從裝置的終止請求，并為最後一次資料傳輸做好了準備。資料的傳輸發生在時鐘3處。
同上例一樣，在STOP#發出之後也又資料要傳輸，但不同之處在于例1的資料傳輸發生在FRAME#撤銷之後，而本例中則發生在FRAME#撤銷之前（時鐘2處）。當從裝置發現資料已經完成，就應該把TRDY#撤銷，也就是說，在該例中，最後一個資料期沒有資料傳輸。
從上圖我們可清楚的看到，在整個的終止過程中，未發生任何資料傳輸，這也是它與前兩個例子的重要差別。實際上，該例本質使屬再試方式，使斷開的一種特殊情況。另外，該例中的FRAME#的撤銷被延遲到時鐘3之後，使因為等待IRDY#的發出。
從上面三個例子，我們也可總結處從裝置終止的一些特點：
1）一旦STOP#信号發出後，它就必須維持其有效狀态直到FRAME#撤銷為止。
2）STOP#信号發出後，FRAME#要盡快撤銷，而FRAME#撤銷後，STOP#也必須在接下來的周期内立即無效。
3）在STOP#有效期間，DEVSEL#也處于有效狀态。
4）從裝置可以決定在STOP#發出之後是否還進行一次資料傳輸，若希望在停止之前進行傳輸，就要使TRDY#在發STOP#的同時有效。
5）從裝置不能再STOP#撤銷後繼續傳輸資料，如果主裝置要想将一被終止的傳輸重新啟動，那麼它就要再稍後的時間内用下一個未傳輸的資料位址來啟動。
6）在從裝置發出STOP#信号之後的資料傳輸不能多于一次。
7）當現行的傳輸被從裝置終止時，主裝置必須撤銷它的REQ#信号，并保持至少兩個PCI周期；若主裝置要繼續完成被終止的傳輸，它必須在撤銷REQ#兩個時鐘周期之後立即重置REQ#有效，否則就失去了機會，隻有等到以後再次使用總線時再發REQ#信号。
總之，綜合前述内容，在PCI總線上的所有傳輸操作中，FRAME#、IRDY#、TRDY#和STOP#這幾個信号一般都遵循下列規則：
1）當STOP#信号有效時，FRAME#應在其後的2~3各時鐘周期内盡快撤銷，但在撤銷時，應置IRDY#為有效。而目标裝置應無條件地保持STOP#的有效狀态直到FRAME#撤銷為止。但是，一旦FRAME#撤銷，緊跟着STOP#也必須取消。
2）任何時鐘前沿，若STOP#和TRDY#同時有效就表示是傳輸的最終周期，IRDY#要在下一時鐘的前沿之前撤銷，也就是表示傳輸的結束。
3）對于被目标終止的對話，主裝置若要繼續完成它，就必須用下一個未傳輸資料的位址來再試通路。
4）一旦從裝置發出了TRDY#或STOP#，它就不能改變DEVSEL#、TRDY#和STOP#信号，直到目前的資料期完成。