這部作品從國小開始就陪伴着我們，甚至還記得每天傍晚五點半守在電視前的那種期待，希望本篇文章能再次喚醒我們童年時的回憶
那是一個氣候異常的夏天，有七位參加夏令營的孩子，他們分别是八神太一、武之内素娜、石田大和、全光子郎、太刀川美美，高石武以及成護丈阿助，其中阿五和阿和是父母離異的兄弟
8月1日這天他們被困雪山，并有7個神聖計劃從天而降，就此孩子們穿越到數位世界，成為被選召的孩子
每個孩子身邊都出現了一個相伴的數位寶貝。太一是滾球獸，光子郎是年糕獸，素娜是比高獸，阿武帶着迪哥獸，大河帶着獨角獸，阿柱有的是布加獸，美美有的是種子獸
目前他們所在的地方叫做法一陸島，在此古加獸襲擊了他們，為了守護孩子們，數位寶貝們毅然決然的迎戰對手，突然神聖計劃産生震蕩，一段音樂随之響起
滾球獸進化——亞古獸 比高獸進化——比丘獸
年糕獸進化——甲蟲獸 獨角獸進化——加布獸 迪哥獸進化——巴達獸
布加獸進化——哥瑪獸 種子獸進化——巴魯獸
伴随着這段音樂，數位寶貝們最初的進化完成，很快擊敗了古加獸，不過古加獸也弄斷懸崖，讓孩子們掉入水中
接着大家從水路先來到海邊尋找回去的方法，在此他們遇到了貝殼獸的攻擊，為了保護大家，太一和亞古獸勇敢地站了出來
在神聖計劃的光輝下，亞古獸進化為暴龍獸
暴龍獸用超級火焰輕松擊敗了貝殼獸之後，一行人寄住在一個湖心島上。當夜，海龍獸卻從水中發起攻擊，并一把抓住阿和
布加獸為了保護阿和實作進化，成為加魯魯獸。在加魯魯獸的妖狐火焰下，海龍獸落敗收場，第二天他們再次上路，并發現了一個比高獸的村子
這時被黑色齒輪控制的火焰獸從山上下來的。比高獸們都被吓得四處逃竄，為了保護素娜和比高獸們，比丘獸進化成巴多拉獸，并用隕石聚翼打倒了火焰獸
黑色齒輪從火焰獸體内飛出後，火焰獸恢複正常，接着衆人繼續旅途，來到一個廢棄工廠，在這裡他們遇到了完全體的安杜魯獸，不幸的是黑色齒輪也進入了安杜魯獸體内
被黑色齒輪控制的安杜魯獸開始追擊孩子們，他的實力異常強大，暴龍獸和加魯魯獸都不是對手。在逃跑途中，光子郎進入了一個充滿代碼的房間，作為少年程式員，光子郎立刻動手開始程式設計
光子郎的操作讓甲蟲獸渾身發燙并綻放光芒，就此進化成為比多獸，他對着安杜路獸的弱點右腿發動米加巨炮破壞了黑色齒輪，安杜魯獸恢複正常
随後一行人從下水道離開工廠，路上他們遇到了一群喜歡丢大便的鼻涕獸，鼻涕獸十分喜歡美美，想與其約會，在鼻涕獸的追趕下，美美遇到了完全體的熊仔獸
熊仔獸把其他人和數位寶貝都抓了起來，危難之際，巴魯獸進化成仙人掌獸，他用尖尖碰碰拳打出了熊仔獸體内的黑色齒輪，這才讓熊仔獸恢複正常
接着大家繼續旅程來到一處水源，并發現了無限山。當夜，責任心最強的阿柱獨自前往無限山檢視，他發現了許多黑色齒輪，并見到了被齒輪控制的獨角馬獸，為了保護阿柱和大家，哥瑪獸進化成海獅獸
海獅獸用魚叉雷射炮摧毀了獨角獸的黑色齒輪，随後一行人登上無限山頂，發現大家竟然身在孤島之中，另一邊，正義的獅子獸被惡魔獸控制變得邪惡
邪惡獅子獸與奧加獸聯手殺向孩子們。見狀，數位寶貝們全部進化聯手對敵，這才趕跑對手。之後，孩子們來到了一個别墅準備休息，但是這一切都是惡魔獸所制造的陷阱幻象。惡魔獸已經用黑色齒輪控制了整個法易路島
惡魔獸将法易路島分裂成數塊，并讓獅子獸去幹掉太一。千鈞一發之際，神聖計劃發出光芒淨化了獅子獸
受到淨化後的獅子獸留下阻攔惡魔獸，孩子們則是被四分五裂的島嶼帶往各地，然而不過一個照面，獅子獸卻再次被惡魔獸控制。太一這邊遇到了被黑色齒輪控制的雪人獸，太一與亞古獸聯手，擊碎了雪人獸的黑色齒輪
在雪人獸的幫助下，太醫與阿和會合，他們先是聯手戰勝魔人獸，然後用妖狐火焰使島嶼中的黑色齒輪反向旋轉，使得原本分裂開的島嶼開始向中心靠攏
與此同時，美美遇到了大便獸和芝蒙獸，在神聖計劃的淨化下，大便獸變得善良友好，他幫助美美找到了光子郎，衆人還在遺迹中淨化了人馬獸
人馬獸告訴美美，神聖計劃可以用來驅逐黑暗之後，美美踢了一腳黑色齒輪，使得齒輪倒轉，島嶼回歸。另一邊，阿柱遇到素娜，他們合力戰勝了猛鬼獸，并與海獅獸和巴多拉獸一起傳回無限山
阿武和巴達獸到了創始村，并遇到了照顧數位蛋的艾力獸，其實每個數位寶貝在死亡後都會化為資料回到創始村，這時獅子獸前來攻擊，他還吸收了許多黑色齒輪，變得異常強大
好在太一等人及時趕到，并用神聖計劃淨化獅子獸。随後獅子獸給孩子們講了一個傳說，每當數位寶貝世界遇到危機就會有孩子們前來拯救，是以大家猜測解決完危機後就可以傳回原有世界
于是衆人動身來到無限山，準備消滅惡魔獸，但是惡魔獸吸收了奧加獸和無數黑色齒輪，十分強大，所有數位寶貝合力都不是他的對手
危難之際，巴達獸為了保護阿武，進化為天使獸
在天使獸的絕招天堂之拳下，惡魔獸被徹底消滅，而天使獸也力量耗盡退化成了一顆數位蛋
法易路島恢複正常，奧加獸也逃離而去，孩子們見到了一個全息投影老爺爺玄内。他請求孩子們去對岸打敗更強大的敵人，而數位寶貝也可以用徽章和進化鑰匙再次進化
不過徽章分散在對岸的沙巴大陸各處，進化鑰匙也被惡魔獸藏了起來，需要衆人尋找。玄内還給予了一張沙巴大陸的地圖，第二天孩子們乘坐木筏前往對岸，數位蛋也孵化出浮遊獸。途中他們還幫助巨鲸獸消除了體内的黑色齒輪
巨鲸獸帶着孩子們找到了進化鑰匙，過程中他們又解決了被黑色齒輪控制的鑽地獸，随後巨鲸獸帶着孩子們來到了沙巴大陸。上岸之後，衆人先是解決了一群柏古獸和加支獸，并拯救了滾球獸的村落和浮遊獸，随後浮遊獸也進化成了迪哥獸
柏古獸和加支獸其實都是悟空獸的部下，悟空獸向孩子們發動進攻，他用愛心光線奪走了數位寶貝的力量，并用黑暗死靈球攻擊整個村落
無奈之下，孩子們隻能逃跑，在避難山洞中，太一還找到了自己的勇氣徽章，不過由于這個徽章，太一開始提高對亞古獸的期待，甚至有些操之過急
随後孩子們前往附近的競技場尋找其他徽章，而悟空獸則是通過電線知曉了孩子們的行蹤。他遠端操控陷阱困住了孩子們，隻有吃的太飽，跑不動的牙古獸沒有被困。接着悟空獸派出一頭暴龍獸進攻，這頭暴龍獸輕松擊敗了亞古獸進化的暴龍獸
這時孩子們在地闆上找到了阿柱的誠實徽章，借此他們逃出了陷阱，然而太一卻執意要求暴龍獸進化打敗敵人，這種執念使得暴龍獸進化錯誤，成為喪屍暴龍獸
喪屍暴龍獸解決了對手并不分敵我的進行攻擊，最終喪屍暴龍獸耗盡了能量，通過這次經曆，太一才意識到自身的問題，他決定要端正心态，重新迎接挑戰
孩子們繼續趕路來到沙漠，他們遇到了悟空獸的手下巨基獸，随即巴多拉獸和仙人掌獸聯手擊敗了對方，美美則是在一顆仙人掌中找到了自己的純真徽章，接着孩子們在沙漠中前進，并遇到了完全體的妖精獸
妖精獸先是擊退了來襲的古家獸，然後決定要幫助孩子們修煉，提升實力，于是孩子們都進入妖精獸的結界開始修行。一段時間後，光子郎和阿和根據感應離開結界，并在枯井中發現了知識徽章和友情徽章
但是悟空獸也獲知了孩子們的位置，他派出巨龍獸打碎結界，并用電纜遠端使出愛心光線，吸收數位寶貝能量
就在妖精獸苦苦支撐之際，太一和亞古獸修煉歸來，太一重拾勇氣，亞古獸進化成為暴龍獸，在超級火焰下，巨龍獸不敵落敗收場
随後孩子們滿懷信心，踏上征途。途中，阿武獲得了自己的希望徽章，接着他們來到了一個充滿代碼的世界，在這邊光子郎推測數位寶貝世界就是地球資料的映射，而每個孩子其實都是由資料構成，之後他們救出了曾被悟空獸擊敗的分子獸，這時悟空獸也來到現場
分子獸發動無差别攻擊，其實分子獸也是一個壞的數位寶貝。不過，他打不過悟空獸，是以奪走了素娜逃離而去。為了取勝，分子獸複制了一個素娜，并拿出愛心徽章，他想借助比丘獸的力量擊敗悟空獸
另一邊孩子們拖住了悟空獸的步伐，太一鼓起勇氣闖過電網找到了分子獸，他一把奪過愛心徽章，并抓住了即将掉落暗黑空間的素娜，然後比丘獸進化成巴多拉獸，救出了素娜和太一
突然悟空獸也殺到此地，分子獸準備與悟空獸同歸于盡，一同掉落暗黑空間，但是悟空獸卻和暗黑空間的力量融合，變得更加強大。危難之際，太一和暴龍獸勇敢的應戰對手，奇迹發生，暴龍獸超進化成機械暴龍獸
機械暴龍獸用絕招究極破壞炮，成功擊敗了悟空獸，不過這種力量也産生了空間扭曲，太一和機械暴龍獸都被吸入其中，并回到了現實世界
這時現實世界的時間還是8月1日，沒有絲毫變化，接着太一還遇到了妹妹嘉爾，她對滾球獸十分喜愛，并且也能看到現實世界的數位寶貝
而如今的氣候異常就是數位寶貝來到現實世界所緻，此刻回歸數位世界的大門打開
太一也産生過留在自己世界的想法，不用戰鬥，平靜生活，但他不能這麼做，因為還有事情等着他去做
兩個世界并沒有恢複正常，哪怕對妹妹的不舍，太一依然選擇緊握神聖計劃，飄身而起，與亞古獸一起傳回數位世界
回到數位世界的太一先遇到了迪哥獸，原來大家用一個多月時間尋找太一，無果後就四分五裂，各自離去，阿武被小惡魔獸蠱惑，抛棄了迪哥獸
在太一和躲于暗中的素娜的幫助下，小惡魔獸的陰謀被拆穿，并被進化後的巴達獸擊敗。阿武也和巴達獸重歸于好，另一邊阿和遇到了阿柱，阿柱正被蛋蛋獸拘禁打工，原來這一切也是小魔獸的陰謀
好在蘇娜一直躲在暗中幫助阿柱與阿和，屢次化解危機，這時太一和阿武也來到此地，蛋蛋獸見狀本性畢露，在友情徽章的激勵下，加魯魯獸超進化成獸人加魯魯
獸人加魯魯用絕招凱撒瑞爪擊敗了蛋蛋獸，接着大家兵分兩路去尋找失散的孩子們。光子郎被小惡魔獸的路牌引入陷阱，在此他被宇宙腦魔欺騙，放棄了求知欲，小惡魔獸，還用宇宙腦魔喜愛的東西為條件要求宇宙腦魔奪取光子郎的進化鑰匙
甲蟲獸退化成泡沫獸用眼淚換回了光子郎的本心，在找回進化鑰匙和求知欲後，比多獸進化成超比多獸，并用超大腳炮成功擊敗了宇宙腦魔
阿武和阿和找到光子郎，玄内也再次出現，給予光子郎數位寶貝電子圖鑒，另一邊太一和阿柱在城堡中找到美美，美美提出想要在這裡當公主并不理會太一等人
好在素娜在夢中幫助美美找回了本心，美美還用歌聲幫助怪蛙獸和蝌蚪獸喚醒了怪蛙王，然而怪蛙王卻是以開始暴走，見狀機械暴龍獸用究極破壞炮擊敗怪蛙王，使其沉睡，随後六個孩子成功團聚，隻差素娜一人
與此同時，小惡魔獸的主人吸血魔獸出現，他狠狠懲罰了小惡魔獸的辦事不力，畢竟在小惡魔獸的助攻下，孩子們都學會了超進化，這次他将魔爪伸向了素娜，不過後來素娜總算與夥伴們相遇
在大家的幫助下，素娜恢複平靜，當夜吸血魔獸在血色月光下降臨，對孩子們發動猛攻，一個照面數位寶貝全被擊倒，素娜則是抱着比丘獸，想起了童年媽媽對自己的愛護，随即素娜與愛心徽章共鳴
巴多拉獸超進化成伽樓達獸，在伽樓達獸的保護下，孩子們總算脫離險境，在此之後，玄内告訴大家要去找第八位孩子
同時吸血魔獸也知曉了這個情報，他想要打開城堡中通往現實世界的大門，而亞古獸等數位寶貝則是混入吸血魔獸的部下之中進入城堡
然而吸血魔獸一步先行前往現實世界，并關上大門。不過後來孩子們在玄内的幫助下也回到了現實世界。這個過程中，大家都承認了太一的隊長身份，因為正是太一的貢獻才使得大家再次團聚
現實世界吸血魔獸正通過徽章尋找第八個孩子，與此同時，太一等人也來到觀秋，他們還想起了4年前的一次數位寶貝降臨事件，正是因為看到了這次事件，他們才成為被選召的孩子，接着大家也開始尋找第八位孩子
衆人還化解了許多吸血魔獸手下的攻擊，比如長毛象獸，烏賊獸，爛泥獸，死神火焰獸的來襲，其實第八位孩子正是太一的妹妹八神嘉爾，不過她的神聖計劃被貓給叼走，并被一隻烏鴉撿走
嘉爾在尋找貓的途中偶遇迪路獸，迪路獸本想抓捕嘉爾，但卻不知為何無法下手，無奈之下選擇先離開
阿武和阿和遇到了貪玩的南瓜獸和礦石獸，對方熱衷玩樂，全然忘記了自己打勞工的身份，是以吸血魔獸老闆将他們殺死。見狀憤怒的阿和指揮獸人加魯魯對戰吸血魔獸
接着巴達獸也進化成天使獸趕來助戰，合力趕跑敵人。迪路獸的好友巫師獸找到了嘉爾的神聖計劃，他騙過小惡魔獸，并将神聖計劃交給迪路獸，在巫師獸的幫助下，迪路獸再次找到嘉爾，并确認了眼神，發現的确是對的人
迪路獸回想起自己從幼年還是小狗獸時期就一直在等待嘉爾，而嘉爾也知曉了自己就是第八位被選召的孩子
迪路獸和巫師獸去吸血魔獸的基地偷取光明徽章，但是他們卻被吸血魔獸當場抓住并被擊敗。吸血魔獸還抓着迪路獸去找第八位被選召孩子
此時整個地區都起了大霧，各種通訊也被中斷，這一切都是吸血魔獸引起，他還派出自己的部下四處抓人，但迪路獸确認身份，這時孩子們都與數位寶貝一起展開救援行動，其中仙人掌獸超進化成花仙獸一舉馴化了黑暗巨龍獸
不過黑暗巨龍獸很快就被吸血魔獸老闆狠心殺死，阿柱這邊與阿武在救援途中遇到了超海龍獸的襲擊，于是海獅獸超進化為阻盾獸并用重錘火花将超海龍獸擊敗
阿柱還救起了漂流到此的巫師獸，嘉爾不忍心看着世界受到災難，是以向死神獸承認了自己的身份，并被對方抓走
很快吸血魔獸就根據情報來到了電視台，而孩子們也都得知情況趕往電視台彙合，随即雙方展開了激烈的交鋒，數位寶貝們都變身完全體迎戰吸血魔獸
然而吸血魔獸極為強大，所有數位寶貝都不是對手，接着吸血魔對着嘉爾和迪路獸用出夜魔飛襲
突然，巫師獸擋在了迪路獸身前，他用自己的生命拯救了嘉爾和迪路獸
嘉爾和迪路獸見狀留下淚水
神聖計劃和徽章也都綻放光芒
迪路獸成功實作超進化，成為天女獸。天女獸用神聖光芒恢複同伴數位寶貝們的力量
天女獸集中大家的全部絕招用出一記神聖弓箭，成功消滅了吸血魔獸。然而大霧卻沒有散去，危機也并未解除。根據聖經啟示錄的預言時間來到了6時6分6秒，吸血魔獸重新複活，并進化成究極吸血魔獸
作為體諒下屬的老闆，他立刻吸收了打勞工小惡魔獸，接着孩子們與究極吸血魔獸開始戰鬥，但是對方已是究極體。所有人都不是對手
這時大家根據玄内老人的預言訓示，讓天使獸和天女獸，對阿和與太一射出希望，與光明之箭。伴随着一箭穿心，加布獸與亞古獸的究極進化
亞古獸進化成戰鬥暴龍獸
加布獸進化成鋼鐵加魯魯
他們分别用絕招，一舉将究極吸血魔獸冰凍封印，接着其他數位寶貝也各展身手，在戰鬥暴龍獸的戰鬥龍卷風下，究極吸血魔獸被貫穿，并露出本體。
戰鬥暴龍獸使用蓋亞能量炮，鋼鐵加魯魯施展絕對冷凍劑兩大絕招合而為一，徹底消滅了究極吸血魔獸
但是危機仍然存在，天空竟然倒映着數位世界。為了拯救兩個世界，孩子們用神聖計劃再次傳回數位世界，如今數位世界已經被黑暗四天王統治
黑暗四天王分别是鋼鐵海龍獸，機械邪龍獸，木偶獸以及小醜皇，他們輕松擊敗了全部的數位寶貝。芝蒙獸為了拯救美美而犧牲了自己
危難之際，妖精獸暫時擋住了四天王，孩子們成功逃離，不過妖精獸也是以失去生命。随後孩子們根據妖精獸的訓示，前往黑暗龍卷山。其實，黑暗龍卷山就是法易路島，隻不過被改造如此，孩子們的第一站就是鋼鐵海龍獸的轄區
他們先後擊敗了貝殼獸和亞路加獸，但是卻遭到了鋼鐵海龍獸的激烈反擊，危難之際，巨鲸獸出現幫助孩子們，然而他卻被鋼鐵海龍獸一發嘴炮洞穿頭顱殒命
戰鬥暴龍獸施展絕招戰鬥龍卷風，鋼鐵海龍獸被消滅。其實戰鬥暴龍獸的雙爪武器乃是恐龍克星，随着鋼鐵海龍獸的失敗，大海的圖案也從黑暗龍卷山消退
接着孩子們來到了森林，這裡是木偶獸的領地，在此阿和發現阿武已經成長到能夠獨擋一面，而大家也都各有進步，隻有自己還駐足不前，于是他認為自己不被同伴需要，因而離開了大家，他想要讓自己獨自接受鍛煉，獲得成長
木偶獸的部下祖利獸還蠱惑阿和要成長就要打敗競争對手，而這個對手就是太一，這讓阿和開始産生迷茫，不過加布獸卻堅定的要與阿和并肩作戰，這種情感使得加布獸進化成了鋼鐵加魯魯
一番交手之後，祖利獸提醒木偶獸要小心鋼鐵加魯魯，但是木偶獸身為老闆，下屬的質疑讓其難以忍受，就将打勞工祖利獸滅殺。太一這邊遇見了阿和，阿和要打敗競争對手，兩人開始互毆
鋼鐵加魯魯也與戰鬥暴龍獸展開戰鬥，這時嘉爾聽到聲音，一道強烈的光芒，将孩子們帶到一個空間
嘉爾好像受到控制，向大家講述着數位世界的光明與黑暗，數位寶貝也有多種進化線路。八個孩子象征了八種美好的感情，這才使得數位寶貝能夠向着正确的方向進化，而數位寶貝的進化也可以脫離徽章和鑰匙
其實控制嘉爾的就是希望數位世界能夠和平的人，他們相當于是數位世界的管理者，也正是他們制作了數位蛋和神聖計劃，并選擇了孩子們。後來黑暗四天王攻擊了他們，并搶走徽章。玄内保護着數位蛋和神聖計劃逃走，逃離途中，一顆數位蛋意外掉落，那便是失散的迪路獸
數位蛋在法易路島成功孵化，他們等待着孩子們的到來，直到故事開始的那天，到此，孩子們知曉了故事的來龍去脈，阿和也意識到自己的錯誤，不過他還是要獨自離去，尋找屬于自己的真正道路
美美厭倦了戰鬥，選擇留在原地，阿柱留下陪伴美美，其餘人則是繼續上路。一段時間後天空掉下了一塊隕石
阿柱和美美救助了被隕石波及到的奧加獸，這使得對方改邪歸正感動不已，這時木偶獸出現發起攻擊，同時還出現一個老熟人，正是鋼鐵悟空獸，原來之前的悟空獸在黑暗空間中進化成了究極體
他和木偶獸兩強相鬥，美美等人趁亂逃離。他們還找到了木偶獸的窩點，這時木偶獸也結束了和鋼鐵悟空獸的戰鬥，回到此地
兩方爆發激烈交鋒，最終木偶獸寡不敵衆，武器被毀，他靠着基地變身的機器人拖住對手僥幸逃離，然而行之未久，阿和就找上了他，在鋼鐵加魯魯的濃烈口氣下，木偶獸被消滅
黑暗龍卷山中的森林部分也被成功消除，阿柱他們被鋼鐵悟空獸追擊，危難之際，黃金劍獅獸出現拯救了他們，原來獅子獸也進化成為究極體
為了拯救美美，他還用身體擋下了鋼鐵悟空獸的死亡霹靂，奧加獸用螺旋飛錘成功敲碎了悟空獸的外殼，而黃金劍獅獸也用一記黑虎掏心消滅了鋼鐵悟空獸
不過生機耗盡的他也永遠的離開了這個世界，看着老對手的死去，奧加獸也體會到了孤獨，而獅子獸的勇敢激勵美美走出陰霾，決定去找太一。而太一等人來到了城市，這裡是機械邪龍獸的領域，他們先是擊退了惡霸熊仔獸，救出被關押打工的鼻涕獸
機械邪龍獸知道惡霸熊仔獸失敗後将其滅殺，接着機械邪龍獸親自出手攻擊孩子們，途中安杜魯獸也出現在此，大家一起合力攻擊，為了保護嘉爾等人，鼻涕獸們竟然圍攻了機械邪龍獸，是以他們都失去了自己的生命
嘉爾見狀昏厥過去，而這也激發了亞古獸的力量，最終戰鬥暴龍獸使用鋒利鐵爪擊敗機械邪龍獸
另一邊，美美遇見艾麗獸，他們一同上路尋找太一，而阿柱因為擔心阿和開始動身尋找阿和，發現他身處一個黑暗的山洞，内心也十分消極，好在加布獸用溫暖人心的擁抱喚醒了阿和，這時阿柱也來到此地，兩人總算相逢
與此同時，太一等人來到了黑暗龍卷山的頂部，他們遭遇妖女獸的襲擊，至此，全場最為引人矚目的一場戰鬥拉開帷幕，妖女獸對戰天女獸，在天女獸的天堂紫光下，妖女獸落敗
小醜皇親自登場對戰衆人，此刻阿和等人也趕到戰場，決戰當即展開，然而小醜皇異常強大，用白布将衆人陸續變成玩偶，安杜魯獸也趕過來，但隻能和小醜皇勉強過上幾招
阿武面臨危機，現在隻有他的數位寶貝沒有超進化過，神聖計劃震蕩，徽章發光
目前最強數位寶貝登場，神聖天使獸
神聖天使獸奪回了變成玩偶的衆人，并用神聖複活之光讓大家都複原如初，接着神聖天使獸還打開了通往異界的天堂之門
衆人合力将小醜皇打入了天堂之門，取得勝利。但是還沒等孩子們為勝利高興一會，衆人就掉入了黑暗空間。最終boss出現，它集合了所有進化失敗的數位寶貝的力量，是一種世界扭曲的産物，力量之強不用多言，它能使出之前所有強大敵人的絕招
Boss翻手間就把衆人的神聖計劃和徽章全部摧毀，隻用一招，就讓孩子們灰飛煙滅，分解成了資料代碼。眼看一切都完了，數位寶貝鼓勵孩子們不要放棄
大家都想起了自己的成長，想起了心底深處最美好的感情，衆人鬥志重新燃起，數位寶貝們，進化吧！
迪路獸進化——天女獸
巴達獸進化——天使獸 天使獸超進化——神聖天使獸
甲蟲獸進化——比多獸
比多獸超進化——超比多獸
巴魯獸進化——仙人掌獸 仙人掌獸超進化——花仙獸
哥瑪獸進化——海獅獸
海獅獸超進化——阻盾獸 比丘獸進化——巴多拉獸
巴多拉獸超進化——伽偻達獸
加布獸究極進化——鋼鐵加魯魯
最後是太一的亞古獸
亞古獸究極進化——戰鬥暴龍獸
衆人伴随着進化後的數位寶貝們出現在最終boss面前，所有的數位寶貝都施展出了最終絕招，在衆人的合力一擊之下，最終boss落敗，數位世界終于恢複了正常
危機解除了，但同時也迎來了離别的時刻
如今數位世界已經與現實世界時間同步
當使命完成後，孩子們作為人類無法繼續留在數位寶貝世界
雖然充滿了那麼多的不舍
但終究沒有不散的宴席，也許如果緣分仍在，總有一天還會相遇
加布獸想聽阿和最後再吹一次口琴
太一與亞古獸互相鼓勵，要打起精神
嘉爾将自己的口哨送給迪路獸
巴魯獸難以接受離别而躲了起來，美美無奈隻好登上要遠行的列車
最後時刻，巴魯獸奔跑而來
大家揮淚告别
那頂飛舞的粉色帽子，多少人的童年回憶啊
列車漸漸遠去，數位寶貝第一部就此完結。不得不說第一部的故事非常精彩，甚至其高度使得後作難以超越，乃至後來的重新開機都難以與最初的那種感覺相比拟，鮮活的角色，生動的冒險故事真的是經典之作，願我們青春常在，心中永遠燃燒着希望