
為了進一步提高《微生物組實驗手冊》手稿的品質,該項目增加了一個公開審查程式。通過同行評審後,文章由公衆号推送共享,任何人都可以線上送出修改。公衆号格式顯示略有問題,建議電腦點選文字末尾閱讀原文下載下傳PDF評論。線上文檔(https://kdocs.cn/l/cL8RRqHIL)熱門評論頁面記錄了對名稱,機關和行号索引進行更改的建議。征求意見的截止日期為推文釋出後 72 小時,文章将結合建設性修改進一步修改,以獲得 DOI 線上釋出,并根據貢獻程度被列為審稿人或感謝者。感謝同行的寶貴意見。
淡水動物園的收集和鑒定
淡水浮遊動物的采樣和鑒定
陳燦爛1,2,王文平1,2,楊軍1
1 中國科學院城市環境與健康重點實驗室,中國科學院城市環境研究所福建省生态生态學重點實驗室,水生态健康研究組,福建廈門;
:: 時事通訊作者電子郵件: [email protected]
摘要: 動物區是水生态系統的重要組成部分,淡水中常見的動物園包括原生動物、轉子、支角、腳等。本文以湖浮遊生物為例,介紹了内陸水域浮遊生物的采集、集中、固定、儲存和識别工作流程,可用于動物群落的定量分析。
關鍵詞: 動物平面, 浮遊生物網絡, 内陸水體, 采集, 識别
材料和試劑
1. 波昂試劑
2. 250 mL 樣品收集瓶
3. 5L樣品收集瓶
4. 60 mL 樣品儲存瓶
5. 清洗瓶子
6. 4-自封包
儀器和裝置
1. 集水器 (5 L)
2.25' 浮遊生物網 (孔徑 64 sm)
3. 25'小濾鏡(孔徑64 sm濾鏡)
4. 倒置顯微鏡
5. 解剖鏡
6. 計數盒 (0 .1 毫升, 1 毫升)
7. 移液槍 (0 .2 毫升, 1 毫升)
8. 計數器
9. 解剖針
實驗步驟
1. 取樣前的準備
1.1 示例工作站設定
根據研究目的,當水深小于3米時,很難形成熱分層現象,可以收集表層(0.5米)水體的樣品。在3-10米的深度,分别收集地表(0.5米)和下面的水體(沉積物表面以上1-2米)。當水深大于10米時,根據現場檢測到的水溫特征和溶解氧垂直剖面分布特征,一般收集至少3個水層的樣品,包括表面(0.5米),熱聚合物跳躍或氧氣跳躍層的水圈,溫度跳躍層或氧氣跳躍層(湖的下層, 但沉積物表面向上2米)。
1.2 樣品供應準備就緒
準備5L集水機2台,泵組1台(帶25L桶,水樣定量)進行水樣采集;2 2 x 浮遊生物網絡,250 mL 樣品收集瓶,用于過濾豐富的分支角,基座浮遊生物,5 L 樣品收集瓶,用于收集本地動物,輪蟲病樣品。
制備波昂試劑(1500 mL充滿苦酸,660 mL甲醛,139 mL冰醋酸)。
制備Rugo試劑(20克碘化鉀,10克碘,20毫升冰醋酸,固定容量至200毫升)。
1.3 預采樣檢查
取樣前,檢查集水器是否完好無損,如底部出水口堵塞、挂耳松動等。泵套件是否齊全,如管件、鋼絲磨損、滴答聲牽引繩、電池充電等;浮遊生物網絡是否完好無損,如接口是否破裂,是否有孔洞,交換機是否靈活。樣品瓶提前寫上樣品号,并标記采樣時間和取樣器。
2. 浮遊動物的采集和固定
2.1 原生動物和輪蟲病的定量樣本采集
本地動物和輪蟲個體體積小且數量豐富,可以使用5L集水器或泵直接收集水樣。在現場收集5L水樣作為原生動物和轉子樣品,并立即用Rugo試劑固定樣品。如果水體富營養化較嚴重,原生動物和轉子蠕蟲的密度高,可以适當降低水的回收率,如果水體中原生動物和轉子蠕蟲的密度較低,則可以适當增加水的回收率。
2.2 分支角和蛞蝓的定量樣品采集
1)定量:使用5L集水器或泵收集水樣。用水泵取樣需要在25 L桶中定量。分支和腳組的個體較大且數量較少,通常我們在儲液罐中收集每個樣品6 0 L水樣,作為樹枝和腳樣本進行過濾。如果水體富營養化較為嚴重,樹枝和豆莢的密度可适當降低水回收率,如果水體中樹枝和腳的密度較低,則可以适當增加水回收率。
2)過濾:将6 0L水樣用25 s浮遊生物網過濾,将樹枝和腳類物種濃縮并收集到浮遊生物網中。
3) 收集:将所有過濾過的豐富分支和腳類樣品轉移到250 mL樣品瓶中。
4)清洗網:用過濾水樣清洗浮遊生物網3次,将剩餘的樹枝和腳類一起收集到收集瓶中,以便以後對樹枝和腳進行定量分析。
2.3 動物園計劃的定性樣本收集
進行了多次拖網捕撈,深度為25-浮遊生物網絡透明度的3倍,并将動物園樣本收集到250 mL收集瓶中,訓示定性樣品,收集時間,地點,收集者,樣品編号。
2.4 示例修複
取樣後立即将波昂試劑固定分支和腳樣品加入現場250mL收集瓶中,終濃度為5%。将Rugo試劑樣品加入5L收集瓶中以固定本地動物和輪蟲病,最終固定劑濃度為1.5%。
3. 祖普拉菲頂級藥物的濃縮和儲存
3.1 原生動物和轉子樣品的再富集
1)将5L收集瓶樣品置于靜态沉澱超過48小時,使用虹吸管緩慢吸出液體。
2)虹吸的流速和流速應放寬,沉澱和虹吸過程不應晃動,如攪拌底部應重新沉澱。
3)當吸收1/3的澄清液時,流量應逐漸減慢(或轉移到500 mL樣品瓶中,然後重新濃縮超過48小時),最終的濃縮水樣品(含有沉澱物)約為20-25 mL,置于樣品儲存瓶(60 mL)中。
4)最後,用少量吸出上層液體沖洗沉澱器3次,并将其倒入樣品儲存瓶中,固定容量為30 mL。如果樣品含有超過30毫升的水,可以再放置24小時,然後再吸收多餘的水(上層液體)。
3.2 重新濃縮角蛋白和足部樣品
使用由 15 mL 離心管制成的 64 m 過濾器進一步濃縮分支和腳類。
1)将固定的分支和腳樣品倒入2 50 mL收集瓶中,并将樣品收集瓶沖洗3次。
2)在離心管開口處伸入樣品儲存瓶(60 mL),并用洗滌瓶沖洗過濾器。
3)反複清洗瓶子3次過濾,清洗過程中連續旋轉過濾器,確定所有分支和污塊進入樣品儲存瓶中。
4)再次檢查數量,将波昂試劑加入樣品儲存瓶中,固定,最終濃度為5%。
3.3 儲存唑啉樣
1)樣品儲存瓶(60毫升)蓋上蓋子後,放入4個包裝袋中,密封,編号。
2)按抽樣編号的順序放入新鮮包裝盒中。
3)放入儲存盒以清潔盒子。
4)按順序将整理盒放在樣品架上。
5)制作樣品表,包括樣品編号,采樣時間,采樣地點,經緯度,采樣水深,水體類型,樣品名稱,存儲位置,記錄儀,檢查員等資訊。
4. Zooplaphytop鑒定和計數
4.1 祖氏菌識别
1)準備顯微鏡,解剖鏡,計數器,解剖針,移液槍(帶0.2 mL頭或1 mL頭,預先切斷尖端以擴大槍口)和計數盒(0.1 mL和1 mL)。
2)參考浮遊動物分類資料進行物種鑒定,要求盡可能識别物種或屬。
3)優勢種和常見種必須對物種進行鑒定,對于難以識别的種種,需要在解剖鏡或逆向顯微鏡下借助解剖針進行進一步鑒定,并對關鍵形态特征拍照,向同行專家交換意見。
4.2 祖普拉托普計數
固定樣品将計入zoopla浮選,實驗記錄應記錄采樣數量,采樣量,固定體積和計數量。
1) 完全搖動樣品後,使用 1 mL 移液槍将 1 mL 支部和足部樣品吸收到 1 mL 計數盒中。使用0.2 mL移液槍将0.1 mL原生動物和轉子的樣品抽取到0.1 mL計數盒中。
2)在顯微鏡或解剖環境下觀察樣本,識别計數并記錄類型,通常每個樣本至少識别300個人,以確定社群資料分析的品質。
3)按計算機關水量的遊牧場數量
在公式中:
N表示1L水樣(個體/L)中動物成形術的數量
V 表示樣品的體積 (L)
VS表示濃縮後樣品的體積(mL)
VO 表示計數樣品體積 (mL)
n 表示微觀世界獲得的個體數 (1)
4.3 浮遊生物量計算
采用體積法,可以将每個遊動物近似為幾何三維形狀,根據體積公式估計生物體積,假設遊動物的密度為1 g/cm3,計算出遊動物的生物量。體積公式參考了張宗軒和黃先飛(1991)對相應物種30個個體的長、寬、高資料,利用該公式得到濕重生物量。
統計和驗證
對每個樣本的浮遊生物資料進行整理,制作物種豐度和生物量資料表,并要求實驗室人員核對整理的資料,如果發現有疑問,應立即對動物飛機樣本進行重新鑒定,計數和處理。形成最終表單,并在确認正确後列印儲存的資料。
謝謝
得益于國家自然科學基金項目(31370471、31672312、91851104)和福建省自然科學基金項目(2019J02016)。
引用
1. 席立紅, 李慧明, 林秋琪, 韓伯平.(2015) 熱帶營養豐富的水庫開放水域動植物群落結構及季節變化——以廣東大沙河水庫為例。湖泊科學, 27(6): 1049-1058.
2. 沈偉芬, 張宗相關, 易毅時刻, 顧滿如, 石鑫, 魏寅新.(1990) 微生物監測技術.北京: 中國建築工業出版社.
3. 張宗相關, 黃向飛.(1991) 淡水浮遊生物研究方法。北京: 科學出版社.
4.Sommer, U., Adrian, R., Domis L. D. S., R., J., Gaedke, U., Ibelings, B., Jeppesen, E., Lurling, M., Molinero, J.C. and Mooij, W.M. (2012) Beyond Plan Andon Ecology Group PEG模型:驅動浮遊生物演替的機制。阿努。修訂版 Ecol. Syst. 43: 429–448.
10000 plus: 細菌分析 嬰兒 和 貓 和 狗 梅毒 狂想曲 Ty DNA 頭發 Nuture 細胞 特刊 腸道指揮大腦
系列教程:微生物組入門 Biostar 微生物組宏基因組
專業技能:學術排行榜 高分文章 不可或缺的人