每一個病人都希望給自己治病的醫生是華佗再世，然而諷刺的是，華佗是中國曆史上第一個死于“醫鬧”的醫生。
想要考察曹操殺害華佗的真正原因，就必須考慮華佗所處的曆史背景，不能單單考慮曹操的原因，曹操是握有生殺大權，然而曹操也愛才惜才，不會無緣無故殺害華佗。
華佗生活在東漢末年，軍閥割據，戰士連連。在那個時代，“學而優則仕”是衆多讀書人的理想目标，而華佗就是衆多讀書人中的一員，他本為“仕人”，入仕為官同樣也是華佗的人生理想。
在東漢時期讀書為官的熱潮已經達到了頂點，漢順帝時期太學生就已經達到3萬多人，學儒讀經為官已經成為社會風尚，而醫藥技術雖為上至帝王、下至百姓所需，但卻被士大夫所輕視，醫生的社會地位并不高，名醫棄醫從政的例子很多，華佗縱然為醫，但心中常感懊悔。
你可能會說，那《三國志·魏書》裡不是有一段記載了華佗被推薦為官的經曆嗎？當時的沛國相陳珪舉薦華佗為孝廉，而太尉黃琬征辟他做官，華佗不是也沒去嗎？
關于這次事件的原因，林振清在自己的文章中指出，這可能有兩個原因:一是華佗才氣大，很自負，陳珪、黃琬舉薦的官職太小，華佗看不上；二是華佗可能迷戀上從醫，為了小官棄醫不值得。
真正的原因還是《三國志》的作者陳壽專門在《方技傳》中揭露，“然本作士人，以醫見業，意常自悔”，一語道破了華佗走上從醫道路的心态。在行醫過程中，他經常感到地位低下，雖然華佗的醫術高明，尋他看病的達官權貴很多，越跟這些人們交流，華佗的失落感就會更加強烈，時間長了，性格就變的怪戾了，很難與人相處了。是以，範晔在《後漢書·方術列傳》中毫不客氣的說:“為人性惡，難得意”。
華佗在後悔和不斷自責的過程中，等待他入仕為官的機會終于到來了。
曹操整日忙于戰事，時常頭痛不止，經人舉薦神醫華佗可治此病，果然華佗用針紮胭愈穴位，效果很好。随着政務軍務日益繁忙，曹操的頭風病越來越厲害，又叫華佗來治。華佗這回說:“此近難濟，恒事攻治，可延歲月”，意思你的病短期内治無法根治，即使長期治療，也隻是延長壽命罷了，言外之意，該倒計時了。
華佗雖為神醫，有些病即使治不了也不足為奇，但是直接跟曹操說死期将近，未免有些危言聳聽，充滿了要挾的意思。
林振清在文章中曾經指出，華佗借給曹操治病的機會，以醫術為手段來要挾曹操給他加官進爵。曹操事後曾說:“佗能愈此，小人養吾病，以此自重”，意思就是華佗想借此給我治病的機會擡高身價，但是曹操沒有立即答應。
華佗便以收到家書為由，回老家去了。到家以後，又以妻子病重無人照顧為托辭，一去不回，對曹操進行再度要挾。
曹操曾多次下令召華佗回都，華佗一直托辭妻子得病，不肯回去，言外之意就是曹操什麼時候給他加官進爵，他就回去。曹操很生氣，派人前去檢視，如果華佗的妻子真生了重病，就給他些錢财買點補品，放寬期限。如果華佗撒謊，就把他抓回來。
結果，華佗果真撒謊，曹操依照漢律，以“欺騙罪”和“不服從征召罪”判處華佗死刑，華佗最終認罪伏法。
《漢書·申屠嘉傳》中記載:“通小臣，戲殿上，大不敬，當斬”，“大不敬”的案例很多，其中“征召不到大不敬”适用于華佗所犯之罪。
羅貫中《三國演義》捧劉貶曹之意，世人皆知，是以人們在印象中普遍認為曹操就是“壞人”，他所做的一切都是“壞事”，而想當然的把華佗定位為“好人”，先入為主的認為曹操殺害華佗的原因就是曹操多疑，然而曆史都是後人所著，不免摻雜個人情感，小說更算不得曆史！