人类来到这个世界上，刚刚开始学会思考的时候，是不用讲什么逻辑及证据的，只要一种说法被大多数人接受，就会被认为是“真理”，因为不用讲逻辑和证据，所以很容易滑入神学。什么样的“道理”才会为大多数人所接受呢？那就是很“引人入胜”的故事，在人类的早期，人类的理解力并不高，与他们的思维相差不大的说法才会被他们所理解，于是在早期的远古人类世界上到处流传着像童话一样的寓言故事和神话传说，世界各地的神话传说并不通用，只局限于一个小的范围内，形成不同的民族文化，因为在上古时期，人与人的交流并不频繁，使得神话传说不能很好地竞争、融合，而形成各自为政的局面。在几年前存在的古希腊神话故事经过了几千年的发展，欧洲和亚洲产生了统一的宗教，随着各民族交往的增加，宗教也开始融合成大的宗教。
最早的人类思维是宗教的思维，这样的思维用不到任何的逻辑和证明，因而宗教思维是人类最低等的思维，但因为它的传播范围广，而具有很大的影响。
希腊神话是原始氏族社会的精神产物，欧洲最早的文学形式。大约产生于公元前8世纪，它在古希腊原住民长期口头相传并借鉴了流传到希腊和其它各国的神话的基础上形成基本规模，后来在荷马的《荷马史诗》和赫西俄德的《神谱》及古希腊的诗歌、戏剧、历史、哲学等著作中记录下来，后人将它们整理成现在的古希腊神话故事，分为神的故事和英雄传说两部分。
看看这个古希腊故事：传说古希腊仙女克丽琪亚爱上了太阳神阿波罗，所以她总是喜欢张望天空，期盼有一天能看到阿波罗驾着火焰战车驶过天际。仙女的身子田野中伫立不动，朝着天空每天追寻着太阳神的踪迹。
她的身体逐渐变得僵硬了，然后化为纤细又坚韧的植物躯干，她的双脚慢慢插进泥土中，美丽迷人的秀发变成了明亮的黄色花冠，仙女克丽琪亚变成了一朵美丽的向日葵，面朝天空，追寻它的挚爱——太阳神。后来向日葵的花语广为流传，象征着沉默的爱。
这是多么唯美的爱情故事？因此古希腊深化能为大都数人“接受”就不奇怪了。随着古希腊的对外扩张，古希腊文化也传遍了欧亚非大陆，成为了欧洲文化的源泉。
当基督教被定为罗马“国教”之后，基督教的神学就开始取代了古希腊神话，到了欧洲中世纪，欧洲大陆上的统一的思维是宗教思维，中世纪的欧洲人的“知识”获得的唯一来源是“教堂”牧师们的讲坛成为了他们的启蒙学校，因为“知识”获得的唯一性，中世纪的人向被洗脑了一样，都是一样的想法，而没有哪怕一点的思想火花。
《圣经》同样有吸引人的故事，这也是基督教得以广泛流传的原因之一，在旧约全书里，亚当和夏娃的故事很引人入胜，在《圣经》中解释了人类的起源，这是人类自我意识觉醒，希望探究自己的历史的表现，《圣经》给出了答案，满足了人类的好奇心，也使得《圣经》更加深入人心。与古希腊神话故事不同的是，在古希腊神话故事中各种不同的种族都是人神结合的后代，人类不过是神与人爱情的意外，而在《圣经》中突出的是上帝爱人，给人以希望，有更高的到的标准，上帝爱所有的人，而不是单独爱某一种族，这也加速了民主大融合，信徒越来越多，基督教成为越来越多的人的信仰之后，信仰就转化为宗教，而基督教对人的思想的控制也就强大起来，反过来限制了其他思想的产生于发展。
本来，在古希腊神话产生之后另一种思考方式在古希腊也产生了，那就是哲学的思考，起初出现的哲学思考都是自然哲学，到了苏格拉底之后的哲学思考的是社会问题，与人类更近了，哲学开始解决世界问题了。哲学优于神学的一点是，哲学的思考要符合逻辑，逻辑是哲学的基础，而神话故事不需要任何的逻辑。
为什么更有道理的哲学没有发展起来？反而被毫无道理的宗教在中世纪占了上风？那是因为哲学的逻辑思维限制了它的发展，要想搞懂哲学，是需要具备一定逻辑思考能力的，在古希腊时期，受过教育的、经过逻辑训练的人并不多，哲学只能在他们之间传播，而不懂得任何逻辑的人是懒得逻辑思考的，由于当时理解不用逻辑思考的人数占优势，基督教就就战胜了更有道理的哲学，这是一个反常的现象，都是教育没能够普及的错。
11世纪以后，欧洲爆发了文艺复兴，文艺复兴之后是教会学校开始吸收平民，教育不再是教会的专利，大量的平民进入教会学院学习，一开始学习拼写和运算，发展到后来教会学校也发生了转变，当时的意大利商业有了发展，行会在意大利流行，学生行会也形成了，行会制改变了学校的构成，为了适应这些学生和学者，以前的教会学校增加了语言、几何等课程，古希腊的文明重新回到了欧洲。
又经过了几百年的演变，大学开始独立于教会之外，现代大学的雏形出现了，伦敦成了欧洲教育的中心，随着现代大学的建立，新式大学培养出来的学者、学生更愿意采用新的方式思考，那就是实证的方法，也是科学的方法，任何的事物只要是可以证明的，就称得上是科学，其它的不过是空想，之前的哲学思考方法，虽然有了逻辑思维，由于空想是思考，缺少了实证，而很容易流入空想。
亚里斯多德描述自由落体出于自己的空想，而到了十六世纪伽利略的一个比萨斜塔的试验就被揭穿了。伽利略能够胜利的原因无他，只是科学的方法——实证，在铁的事实面前，任何的空想都现了原形。连哲学家亚里斯多德都不能幸免。
科学的方法与哲学的方法不同之处在于它不用经过逻辑思考和训练，人们眼见为实，实证胜于雄辩，任何的理论在实证面前都显得苍白无力。围观伽利略自由落体试验的并不都是学者，平民百姓同样可以理解。
对于神学，科学的回击更有力。中国人相信龙的存在几千年了，龙被中国人神话为无所不能，但是当科学进入中国之后，龙的信仰就消失了。科学的方法——实证一下子就错穿了龙的谎言。如果你说龙是存在的，那么你拿出证据来来证明龙的存在，考古发现了几千万年至两亿多年前的恐龙化石，所以说恐龙存在过，化石证明了恐龙的存在。而迄今为止没有发现任何的中国龙的化石，那么中国龙只能是空想，说恐龙存在过是科学，而说中国龙存在只能是神话。
达尔文19世纪发发表物种起源的时候还有反对的声音，1860年6月30日，英国科学促进会在牛津大学图书馆召开的年会却推翻了这个“真理”，700多听众见证了这一时刻，这就是人类科学史、哲学史上的著名的一件大事，史称“ 牛津大辩论”。到了现在没有谁相信神创论了。科学的方法是反击神学最有利的武器。