辣椒底肥每亩可用鸡粪、猪粪及各种生物菌有机肥或平衡复合肥。模式以栽培沟或栽培穴均可，建议最好用垄上覆膜栽培法，这样有利于后期辣椒植株健壮生长，同时达到高产，好管理的作用。
农民所说的化肥二胺指的是磷酸二铵化肥，这种化肥属于是一种高浓度的速效肥料，非常适用于辣椒植株生长和提高土壤肥力，将作基肥或追肥都是非常好的。二胺低氮高磷做底肥使用肥效期为三个月左右，辣椒种植地二胺一定要早施和深施。
二胺中氮含量不多，加上氮肥会流失、挥发，而辣椒植株对氮的需求量也比较高，若常年单一使用二胺而不补充氮肥，会造成磷过量而氮肥不足的问题。农民施用二铵作辣椒基肥应根据土壤中速效磷含量变化的情况，及时调整施肥配方，配施氮肥和钾肥，这样才符合平衡施肥的原则，充分发挥二胺的作用。
有不少的辣椒种植户因土壤肥力跟不上，在种植辣椒前就配用底肥二胺与大量化肥，复合肥能用多少就用多少，用一次不够就再多次追肥，为了保证辣椒的产量，土壤是深受其害，逐渐板结生病失去活性，进而直接阻碍了辣椒的丰产丰收。
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