2020.11.26丨sam转换bam格式报错parse error at line 1解决办法

• 今天照常进行比对工作，涉及到某一个样品需要比对，于是将.sh文件里的脚本直接复制粘贴出来，去掉了循环开始跑，结果是没问题的，但是在下一步使用samtools进行转换的时候发生了报错
  • parse error at line 1
  • truncated file.
• 网上查了一下，发现是bwa可能存在安装问题，不能使用nohup进行运行。参考链接：sam转bam文件报错 - 简书 (jianshu.com)
• 取消nohup之后，正常运行