1. Ambertool安装
使用的环境:module load
- compiler/devtoolset/7.3.1
- mpi/openmpi/4.1.1/gcc-7.3.1
- compiler/cmake/3.23.1
解压,目录内容:
进入amber22_src/build目录,vim run_cmake,根据需要修改一些选项:打开mpi和使用conda
./run_cmake
make install -j 6
amber.python是我们安装gmx_mmpbsa需要的工具,source amber.sh
2. 接下来安装gmx_mmpbsa
./amber.python -m pip install PyQt5
./amber.python -m pip install gmx_mmpbsa
可执行程序路径在:amber22/miniconda/bin里: