1. Ambertool安裝
使用的環境:module load
- compiler/devtoolset/7.3.1
- mpi/openmpi/4.1.1/gcc-7.3.1
- compiler/cmake/3.23.1
解壓,目錄内容:
進入amber22_src/build目錄,vim run_cmake,根據需要修改一些選項:打開mpi和使用conda
./run_cmake
make install -j 6
amber.python是我們安裝gmx_mmpbsa需要的工具,source amber.sh
2. 接下來安裝gmx_mmpbsa
./amber.python -m pip install PyQt5
./amber.python -m pip install gmx_mmpbsa
可執行程式路徑在:amber22/miniconda/bin裡: