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生发技术分享:孟德尔随机化分析结果解读。大家好,最近孟德尔随机化似乎挺火的,今天就给大家讲解一下孟德尔随机化的结果怎么看

作者:概普生信

生发技术分享:孟德尔随机化分析结果解读。

大家好,最近孟德尔随机化似乎挺火的,今天就给大家讲解一下孟德尔随机化的结果怎么看。在MR分析中常见的有以下四张图一张张的进行解读,在这里暴露因素是睡眠时间、结局、冠心病。

·首先这张图是工具变量即SNP的森林图,每一条水平线反映的是单个SNP,利用Wald ratio方法估计出来的结果,实线完全在0左边说明由这个SNP估计出来的结果是睡眠时间增加,能降低冠心病的发病风险。实线完全在0的右边说明由这个 snp估计出来的结果是睡眠时间增加,能升高冠心病的发病风险。

·那些跨过0的结果说明不显著,但是单个SNP的结果并不稳健,因为这里睡眠时间是由多个SNP影响的,所以需要把结果综合起来看,也就是最底下的红线得出两个方法下睡眠时间的升高可以降低冠心病的发病风险。

这张图表示的是暴露因素与结局因素之间的MR分析结果,每一个点其实代表了一个工具变量SNP。每个点上的线实际反映的是95%置信区间,横坐标是SNP对暴露因素,也就是睡眠时间的效应。中枢坐标是 snp对结局因素,也就是冠心病的效应。

两个效应做比值就是暴露对结局的效应,也就是图中彩色线的斜率。不同颜色的线表示的是不同的算法,结果显示不同算法的线总体是斜向下的,这就意味着随着睡眠时间的升高,冠心病的发病风险在降低。

MR分析结果之后需要进行敏感性分析来检验分析结果的可靠性与稳定性。逐个剔除检验就是其中的一种,逐个剔除检验,指的是逐步剔除每个SNP,评估剩余SNP的效应。如果剔除了某一个SNP后结果发生很大改变,说明此SNP对结果影响很大,为异常值需要剔除掉。

如下图所示:剔除每个SNP后总体的误差线变化不大,也就是所有的误差线均在0的右侧,或者所有的误差线都在0的左侧,说明结果是可靠的。漏斗图可以看SNP的异质性,与meta分析中的漏斗图类似,主要关注IVW线的左右两边的点是否大致对称,如果有特别离群的点说明有离群值,可以去除后再次进行MR分析。

至此今天的分享到这里就结束了,感谢大家的关注。

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