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生發技術分享:孟德爾随機化分析結果解讀。大家好,最近孟德爾随機化似乎挺火的,今天就給大家講解一下孟德爾随機化的結果怎麼看

作者:概普生信

生發技術分享:孟德爾随機化分析結果解讀。

大家好,最近孟德爾随機化似乎挺火的,今天就給大家講解一下孟德爾随機化的結果怎麼看。在MR分析中常見的有以下四張圖一張張的進行解讀,在這裡暴露因素是睡眠時間、結局、冠心病。

·首先這張圖是工具變量即SNP的森林圖,每一條水準線反映的是單個SNP,利用Wald ratio方法估計出來的結果,實線完全在0左邊說明由這個SNP估計出來的結果是睡眠時間增加,能降低冠心病的發病風險。實線完全在0的右邊說明由這個 snp估計出來的結果是睡眠時間增加,能升高冠心病的發病風險。

·那些跨過0的結果說明不顯著,但是單個SNP的結果并不穩健,因為這裡睡眠時間是由多個SNP影響的,是以需要把結果綜合起來看,也就是最底下的紅線得出兩個方法下睡眠時間的升高可以降低冠心病的發病風險。

這張圖表示的是暴露因素與結局因素之間的MR分析結果,每一個點其實代表了一個工具變量SNP。每個點上的線實際反映的是95%置信區間,橫坐标是SNP對暴露因素,也就是睡眠時間的效應。中樞坐标是 snp對結局因素,也就是冠心病的效應。

兩個效應做比值就是暴露對結局的效應,也就是圖中彩色線的斜率。不同顔色的線表示的是不同的算法,結果顯示不同算法的線總體是斜向下的,這就意味着随着睡眠時間的升高,冠心病的發病風險在降低。

MR分析結果之後需要進行敏感性分析來檢驗分析結果的可靠性與穩定性。逐個剔除檢驗就是其中的一種,逐個剔除檢驗,指的是逐漸剔除每個SNP,評估剩餘SNP的效應。如果剔除了某一個SNP後結果發生很大改變,說明此SNP對結果影響很大,為異常值需要剔除掉。

如下圖所示:剔除每個SNP後總體的誤差線變化不大,也就是所有的誤差線均在0的右側,或者所有的誤差線都在0的左側,說明結果是可靠的。漏鬥圖可以看SNP的異質性,與meta分析中的漏鬥圖類似,主要關注IVW線的左右兩邊的點是否大緻對稱,如果有特别離群的點說明有離群值,可以去除後再次進行MR分析。

至此今天的分享到這裡就結束了,感謝大家的關注。

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