洪都拉斯位于太平洋和加勒比海之间，东北部是未开发的大型低地丛林，西北部是人口稠密的低地河谷，可可河将洪都拉斯与尼加拉瓜分开。
北部较大的加勒比低地和与丰塞卡湾接壤的太平洋低地以冲积平原为特征。三个自然地理区域的气候类型各不相同。加勒比低地属热带潮湿气候，高温多湿，全年降雨分布相当均匀。
该地区被认为是生物多样性热点，发现了许多植物和动物物种。与该地区其他国家一样，它拥有丰富的生物资源。洪都拉斯拥有超过6,000种维管植物，其中超过十分之一是兰花，还拥有大约250种爬行动物和两栖动物、700多种鸟类，110种哺乳动物其中一半是蝙蝠。
洪都拉斯的经济主要以农业为主，2013年占其国内生产总值的14%。该国的主要出口产品是咖啡（3.4 亿美元），占洪都拉斯总出口收入的22%。香蕉乃是该国第二大出口品。
因为洪都拉斯地理位置特殊，北临加勒比海，南靠太平洋，该国境内地势复杂，种植咖啡区域海拔高。而且，洪都拉斯的气候温和。适宜的气温加上极高的海拔，令咖啡树患病几率大大减少，用更多的能量去生长出一颗颗美味可口的咖啡果实。
洪都拉斯如今是中美洲地区最大的咖啡生产国之一，也是世界第七大咖啡产国，仅2017年到2019年期间，洪都拉斯咖啡豆产量超过45万吨，2020年洪都拉斯咖啡产量33.6万吨。
洪都拉斯的咖啡主产区有科潘（Copan）、欧巴拉卡（Opalaca）、蒙德西犹斯（Montecillos）、巩玛阿瓜（Comayagua）、阿卡塔（Agalta）、帕拉索（El Paraiso）。每一个产区的咖啡豆都有自己独特的品质。
洪都拉斯有两项世界遗产，为科潘的玛雅遗址与普拉塔诺河生物圈保护区。
玛雅城邦遗址位于尤卡坦半岛中部，是古玛雅帝国最大最繁华的城邦，始建于公元514年。奇琴伊察玛雅（Chichen Itza）城邦遗址，曾是古玛雅帝国最大最繁华的城邦。科潘玛雅遗址是玛雅文明最重要的地区之一，有着宏大的建筑。
保护区内的白色城市--布兰卡城，是最重要的玛雅文化考古遗址之一，属于考古遗迹之列的彼德拉斯平塔达斯岩石雕刻出现于普拉塔诺河流的河床上，据说这是前哥伦比亚时期的一种未知的文化形式。
洪都拉斯有两大主要国际机场，分别为特古西加尔巴的通康丁国际机场与聖佩德羅蘇拉的拉蒙·比列达·莫拉莱斯国际机场，此外在罗阿坦、拉塞瓦、特拉等城市也有机场。洪都拉斯陆上交通以公路为主，铁路只用于运输香蕉和甘蔗等农产品。洪都拉斯有科尔特斯港、特拉、拉塞瓦等海港，该国也是权宜船旗国之一。
洪都拉斯特岗汀机场是世界十大危险机场之一，坐落在高耸的马德雷山脉中，于1934年开始使用。危险因素：跑道最短。
机场的危险因素在于它是跑道最短的国际机场，有公路穿过，跑道末端是悬崖。飞机着陆时必须要迅速下降进场，不只是因为周围地形，更重要的是着陆跑道太短。据统计，从1984年起，平均每个月都有3到4起冲出跑道的事故。1989年，一架未遵照规定进场顺序的客机，直接撞向地面，机上146名乘客和机组人员中的127人，不幸遇难。1997年美国空军运输机冲出跑道，造成3名美国人死亡，2008年，一架中美洲航空A320从20米高处跌落，导致机上3人地面2人死亡。