埃塞俄比亚的河中微生物如何？为何会有强大的耐药性？原因是什么？
耐药病原体的传播是一个全球性的健康问题。大多数研究报告水生环境中存在高水平的抗菌素耐药基因 (ARG)；然而，与沉积物相关的水平是有限的。本研究旨在调查 ARGs 在埃塞俄比亚亚的斯亚贝巴 Akaki 河沉积物和水中的分布。从赤木河五个地点收集的沉积物和水中评估了 84 种 ARG 和 116 种临床重要细菌的多样性和丰度。
大多数 ARGs 是在靠近人类活动的城市中发现的。在河流中部集水区收集的水样含有 71-75% 的目标 ARG，其基因编码氨基糖苷乙酰转移酶 ( aac(6)-Ib-cr )、氨基糖苷腺苷转移酶 (aadA1 )、β-内酰胺酶 ( bla OXA-10 ) 、喹诺酮耐药 S ( qnrS )、大环内酯外排蛋白 A ( mefA ) 和四环素耐药 ( tetA ) 在所有采样点均被检测到。
在所有沉积物中检测到的 ARG 少得多，医院附近的沉积物具有最高的多样性和水平。尽管水平和多样性较低，但在沉积物中没有检测到在水域中也未检测到的独特 ARG。在 Akaki 河中还检测到多种临床相关病原体。研究结果表明，水相，而不是赤木河中的沉积物，是 ARG 和抗生素耐药细菌传播的潜在渠道。
数十年来广泛使用抗生素治疗人类和动物感染，以及作为牲畜的食品补充剂，导致耐药细菌 (ARB) 迅速出现。由 ARB 引起的传染病再次成为主要的全球公共卫生问题，导致某些感染的治疗选择较少。因此，由 ARB 引起的感染引起的发病率和死亡率是二十一世纪最大的医疗保健危机。根据欧洲疾病预防控制中心的数据，在欧洲和欧洲经济区，每年约有 33,000 人死于 ARB 引起的感染。
在撒哈拉以南非洲地区，由于缺乏诊断设施和监测系统不完善，耐药感染的管理变得更加困难。为了控制 ARB 的传播，研究主要集中在临床环境中的分离株，很少关注环境传播 。然而，医疗机构以外的环境在 ARB 的传播中起着重要作用。抗菌素耐药性不能通过简单地管理医疗机构中的问题来解决；因此，必须从跨越人类、兽医和环境边界的 One Health 角度来面对它。
由于粪便细菌和抗生素残留的持续排放，耐抗生素病原体在环境中持续存在。大多数抗生素以其活性形式排出体外，尽管某些抗生素的半衰期较短，不到一天（例如阿莫西林），但根据条件在环境中持续排出会导致假性持久性选择 ARB 的亚抑制浓度。
然而，一些抗生素，如四环素和大环内酯类，在水中的半衰期要长得多，在沉积物中的半衰期甚至更长。 这是相关的，因为水生系统中的沉积物被认为是抗菌素耐药基因 (ARG) 的重要储存库，并促进了抗菌素耐药病原体在环境中的传播。与水生沉积物相关的 ARGs 被认为具有持久性，因此可能会不断释放到相关的水域中。因此，了解沉积物和水相中 ARG 的多样性对于可持续的抗菌素耐药性控制非常重要。
人类活动对水生环境的负面影响是对抗菌素耐药病原体持续传播的担忧。细菌可以通过突变和水平基因转移获得抗生素抗性，这不仅有助于水生环境中抗性基因的丰度和多样性，而且还将它们分布在不同的细菌中。然而，水生环境中 ARB 的一个主要来源是医疗设施和家庭未经处理的污水排放。
大多数这些研究都使用基于培养的方法，通常涉及在一般或选择性培养基上分离目标细菌，然后评估 ARG。评估环境中可培养细菌的抗生素耐药性只会提供部分信息，并且会错过检测不可培养细菌中的 ARG。
结论：
沉积物中的 ARGs 水平始终低于水域。内酰胺酶编码基因在沉积物中的多样性和丰度较低，而氨基糖苷类和氟喹诺酮类抗性基因则更为丰富。受城市影响的水生环境的水相，而不是相关的沉积物，可能是 ARG 以及 ARB 在 Akaki 河中持续存在和传播的主要来源。ARGs 水平最高的是受一系列人类活动影响的城市地点，包括农业、医院、工业、和人口稠密的住宅区，这些地区释放未经处理的废物并促成了 ARG 的多样性和丰富性。
因此，河流成为主要临床相关 ARGs 的储存库，这些 ARGs 可能在河流中的环境和病原菌之间传播，随后传播给居民，从而造成公共卫生风险。为有效实施抗菌药物管理计划，还必须考虑环境在 ARG 的产生和传播中的作用。本研究强调了在埃塞俄比亚的抗菌素耐药性监测系统中考虑水生环境对于有效控制耐药细菌和耐药基因传播的重要性。
河流成为主要临床相关 ARGs 的储存库，这些 ARGs 可能在河流中的环境和病原菌之间传播，随后传播给居民，从而造成公共卫生风险。为有效实施抗菌药物管理计划，还必须考虑环境在 ARG 的产生和传播中的作用。本研究强调了在埃塞俄比亚的抗菌素耐药性监测系统中考虑水生环境对于有效控制耐药细菌和耐药基因传播的重要性。
