水产养殖肥料的目的是生产有益菌和藻类，平衡有益菌和藻类的生长繁殖。水中的基本养分由碳、氮、磷、钾等微量元素和大量有机物组成，而水中有益菌和藻类所需的养分则不同，养殖池中所含的养分决定了藻类和细菌的生长趋势。水产养殖中水的营养比在碳氮比和氮磷比两个方面具有重要意义。
水体中有益细菌的生长和繁殖所需的碳氮比为20比30：1，这意味着有益细菌需要20至30份碳来分解1份氮。一般来说，水中不乏氮源，残留的饵料、未消化的粪便、死藻和昆虫中含有大量的氮源，而这些氮源是有益菌和有益藻类必需的营养，如果这些氮源过多，有益藻类和有益菌在使用时会残留，利用好藻类和有益菌， 在氧气不足的情况下形成氨氮和硝基氮气，最终变成有毒有害的氨氮和亚盐。有益藻类的生长和繁殖也需要碳源的参与，理想的碳氮比为6：1。为了达到有益细菌和有益藻类之间的平衡，建议将水中的碳氮比保持在15：1。
因此，当水中的氨氮和亚盐含量超过标准时，除了增加水体溶解氧的同时，补充有益菌，如孢子、EM菌、光合作用菌、乳酸菌等，补充一定量的红糖、糖蜜等有机碳源，则增加了有益菌和有益藻类分解氮源的能力， 从而降解水中的氨氮和亚盐。同样在脂肪水中，为了促进有益藻类和有益细菌的生长繁殖，每英亩使用5至7磅红糖补充有机碳源，补充有益藻类，增加脂肪水成功的机会。
有益藻类的生长繁殖与水中的氮磷含量直接相关，当水中全氮与总磷的浓度比为12：1~13：1时，平均值为12：1，有利于藻类生长，但铜绿微囊藻在氮磷比下（N/P是生长在4.5以下的最佳）， 而抖音在低氮磷比（N/P-0.45）下生长最好，因此从数值可以看出，在高氮磷环境中，氮磷比低，磷含量过高，蓝藻容易爆发。
从以上数据分析中可以看出，如果水中磷元素缺乏，藻类不易培养，当脂肪水效果不理想时，藻类难以培养，要考虑磷含量是否不足，适宜的磷含量，可以提高脂肪水的效果，更好地培养有益藻类。