水産養殖肥料的目的是生産有益菌和藻類，平衡有益菌和藻類的生長繁殖。水中的基本養分由碳、氮、磷、鉀等微量元素和大量有機物組成，而水中有益菌和藻類所需的養分則不同，養殖池中所含的養分決定了藻類和細菌的生長趨勢。水産養殖中水的營養比在碳氮比和氮磷比兩個方面具有重要意義。
水體中有益細菌的生長和繁殖所需的碳氮比為20比30：1，這意味着有益細菌需要20至30份碳來分解1份氮。一般來說，水中不乏氮源，殘留的餌料、未消化的糞便、死藻和昆蟲中含有大量的氮源，而這些氮源是有益菌和有益藻類必需的營養，如果這些氮源過多，有益藻類和有益菌在使用時會殘留，利用好藻類和有益菌， 在氧氣不足的情況下形成氨氮和硝基氮氣，最終變成有毒有害的氨氮和亞鹽。有益藻類的生長和繁殖也需要碳源的參與，理想的碳氮比為6：1。為了達到有益細菌和有益藻類之間的平衡，建議将水中的碳氮比保持在15：1。
是以，當水中的氨氮和亞鹽含量超過标準時，除了增加水體溶解氧的同時，補充有益菌，如孢子、EM菌、光合作用菌、乳酸菌等，補充一定量的紅糖、糖蜜等有機碳源，則增加了有益菌和有益藻類分解氮源的能力， 進而降解水中的氨氮和亞鹽。同樣在脂肪水中，為了促進有益藻類和有益細菌的生長繁殖，每英畝使用5至7磅紅糖補充有機碳源，補充有益藻類，增加脂肪水成功的機會。
有益藻類的生長繁殖與水中的氮磷含量直接相關，當水中全氮與總磷的濃度比為12：1~13：1時，平均值為12：1，有利于藻類生長，但銅綠微囊藻在氮磷比下（N/P是生長在4.5以下的最佳）， 而抖音在低氮磷比（N/P-0.45）下生長最好，是以從數值可以看出，在高氮磷環境中，氮磷比低，磷含量過高，藍藻容易爆發。
從以上資料分析中可以看出，如果水中磷元素缺乏，藻類不易培養，當脂肪水效果不理想時，藻類難以培養，要考慮磷含量是否不足，适宜的磷含量，可以提高脂肪水的效果，更好地培養有益藻類。