近年来，空间多组学技术可谓是科研界的新宠，它可以弥补单细胞测序没有空间位置信息的缺憾，也可以解决病理学家想在一张切片上检测更多信息的困扰。但是，对于很多已经保存在玻片上的FFPE样本，如何再次利用，进行空间多组学分析呢？别急，10x Genomics最近推出的新品，可以让您扩大样本使用范围，简化样本管理。
Visium CytAssist 简介
全新的Visium CytAssist是一款小巧的台式仪器,能够将FFPE组织切片上的转录组和蛋白质分析物从标准的组织学载玻片转移到Visium玻片上,实现组织切片的空间多组学分析。比如病理科存档的很多样本都是贴在普通载玻片上的FFPE组织切片，我们可以利用这台仪器，将普通载玻片上的FFPE组织切片的转录组和蛋白质分析物，转移到我们的Visium玻片上，从而进行空间多组学信息的探索。此外，我们也可以通过普通载玻片上的FFPE样本H&E或者免疫荧光染色的结果，预先选取我们感兴趣的样本或者组织区域，然后通过Visium CytAssist进行目标切片/目标区域上转录组和蛋白质分析物的转移，进而进行空间多组学的分析，从而将空间多组学技术广泛地应用于不同归档、放置状态的FFPE样本，并显著提高实验精度、灵活性、便利性和效率，并节约实验成本。
Visium CytAssist 技术原理
首先将FFPE组织切片贴放在标准载玻片上，继而在标准载玻片上进行FFPE组织切片的脱蜡、染色和成像(H&E用于形态学分析,或IF用于蛋白共检测)，然后根据组织形态学或免疫荧光标记选取自己感兴趣的样本，随后进行组织切片的mRNA解交联和探针隔夜杂交。
然后将最多两张标准载玻片和一张含两个捕获区域（6.5 mm x 6.5 mm 或者 11 mm x 11 mm）的Visium玻片放入CytAssist仪器中,让标准载玻片上选取的组织区域与两个Visium捕获区域进行对齐。
仪器内置的成像系统将捕获明场图像，以确定空间方向，并用于下游比对和数据分析, 然后将转录组和蛋白质分析物转移到Visium玻片表面，与Visium玻片对应Spots位置的高密度核酸探针进行杂交，然后通过探针延伸加上空间条形码序列，接下来就可以将带有空间序列的分析物从玻片上洗脱下来，制备测序文库，并进行后续的空间转录组和蛋白质组的空间分析了。
标准的Visium FFPE流程 VS Visium CytAssist的FFPE流程
Visium CytAssist 亮点
- 将转录组和蛋白质组分析物从标准载玻片自动转移到Visium玻片的捕获区域，简化样本处理
- 无需在Visium玻片上直接切片，将样本兼容性扩展到贴有切片的载玻片
- 通过标准的组织学技术预先筛选组织切片，选择出最有生物学意义的切片，从而最大限度地获得Visium实验的见解
- 使用CytAssist专用玻片和试剂，每次运行可从最多两张FFPE组织切片中精确捕获分析物，而时间不到一小时
Visium CytAssist 技术参数
目前，Visium CytAssist已经可以发货了，
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