近年來，空間多組學技術可謂是科研界的新寵，它可以彌補單細胞測序沒有空間位置資訊的缺憾，也可以解決病理學家想在一張切片上檢測更多資訊的困擾。但是，對于很多已經儲存在玻片上的FFPE樣本，如何再次利用，進行空間多組學分析呢？别急，10x Genomics最近推出的新品，可以讓您擴大樣本使用範圍，簡化樣本管理。
Visium CytAssist 簡介
全新的Visium CytAssist是一款小巧的台式儀器,能夠将FFPE組織切片上的轉錄組和蛋白質分析物從标準的組織學載玻片轉移到Visium玻片上,實作組織切片的空間多組學分析。比如病理科存檔的很多樣本都是貼在普通載玻片上的FFPE組織切片，我們可以利用這台儀器，将普通載玻片上的FFPE組織切片的轉錄組和蛋白質分析物，轉移到我們的Visium玻片上，進而進行空間多組學資訊的探索。此外，我們也可以通過普通載玻片上的FFPE樣本H&E或者免疫熒光染色的結果，預先選取我們感興趣的樣本或者組織區域，然後通過Visium CytAssist進行目标切片/目标區域上轉錄組和蛋白質分析物的轉移，進而進行空間多組學的分析，進而将空間多組學技術廣泛地應用于不同歸檔、放置狀态的FFPE樣本，并顯著提高實驗精度、靈活性、便利性和效率，并節約實驗成本。
Visium CytAssist 技術原理
首先将FFPE組織切片貼放在标準載玻片上，繼而在标準載玻片上進行FFPE組織切片的脫蠟、染色和成像(H&E用于形态學分析,或IF用于蛋白共檢測)，然後根據組織形态學或免疫熒光标記選取自己感興趣的樣本，随後進行組織切片的mRNA解交聯和探針隔夜雜交。
然後将最多兩張标準載玻片和一張含兩個捕獲區域（6.5 mm x 6.5 mm 或者 11 mm x 11 mm）的Visium玻片放入CytAssist儀器中,讓标準載玻片上選取的組織區域與兩個Visium捕獲區域進行對齊。
儀器内置的成像系統将捕獲明場圖像，以确定空間方向，并用于下遊比對和資料分析, 然後将轉錄組和蛋白質分析物轉移到Visium玻片表面，與Visium玻片對應Spots位置的高密度核酸探針進行雜交，然後通過探針延伸加上空間條形碼序列，接下來就可以将帶有空間序列的分析物從玻片上洗脫下來，制備測序文庫，并進行後續的空間轉錄組和蛋白質組的空間分析了。
标準的Visium FFPE流程 VS Visium CytAssist的FFPE流程
Visium CytAssist 亮點
- 将轉錄組和蛋白質組分析物從标準載玻片自動轉移到Visium玻片的捕獲區域，簡化樣本處理
- 無需在Visium玻片上直接切片，将樣本相容性擴充到貼有切片的載玻片
- 通過标準的組織學技術預先篩選組織切片，選擇出最有生物學意義的切片，進而最大限度地獲得Visium實驗的見解
- 使用CytAssist專用玻片和試劑，每次運作可從最多兩張FFPE組織切片中精确捕獲分析物，而時間不到一小時
Visium CytAssist 技術參數
目前，Visium CytAssist已經可以發貨了，
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