印度尼西亚国土存在一个独特现象，就是与其他国家在一个岛屿上共分国土。
第一个是加里曼丹岛，印度尼西亚与文莱、马来西亚共分。之所以会出现“一岛分三国”现象，是因为历史上这个岛是英、荷属地的分割线所在。
第二个是帝汶岛，帝汶岛为印度尼西亚与东帝汶共分，历史上这个岛分别为荷兰与葡萄牙所占。1975年东帝汶被印尼吞了，后来2002年又重获独立。
第三个是新几内亚岛，新几内亚岛被分为两部分，西部归印度尼西亚，东部归巴布亚新几内亚。历史上这个岛曾被荷兰、德国、英联邦澳大利亚自治领三国瓜分。二战后，印尼继承了荷兰的那部分，剩下的归巴布亚新几内亚继承。
