在很多果农们的意识里，土壤是由土、枯枝烂叶等有机质，各种氮磷钾营养元素和水分组成的。但实际上土壤的出现，是地球上出现了微生物，微生物把石头（矿石）分解，成为可以被植物利用的元素，把有机质（动植物尸体、粪便）分解成植物根系可利用的有机质，从此产生了土壤。有了土壤才有了动植物生长的环境和循环的介质，分解有机物被植物利用。
微生物使一切腐烂，包括土里面的枯枝烂叶、动物尸体、有机肥，都是靠土壤微生物的作用才能让土壤中有机物腐烂分解，转化成供作物食用的营养元素，形成腐殖质，让土壤更营养，更健康。
那么，微生物在柑橘园到底发挥着怎样的作用呢？下面我们一起来看看。
1、提高产量
实践证明，微生物菌肥不仅为农作物提供营养元素，其有效菌还能分泌赤霉素、细胞分裂素、生长素等活性物质，刺激、调节、促进作物的生长发育，有利于农作物增产。
2、改善品质
微生物菌肥能有效地改善农产品品质。实践证明，施用微生物肥水收获的柑橘，糖分、维生素、氨基酸等有益成份含量明显提高，籽粒、果实丰满光滑，果品色泽亮丽，既好吃又好看，价值还高。微生物菌肥还可以减少硝酸盐的积累，提高农产品的安全性。
3、增强作物的抗逆性能
大多微生物菌肥中的有效菌，具有分泌抗生素类物质和多种活性酶的功能，能抑制或杀死致病菌，降低病害发生及增强作物的抗逆性，如可增强农作物的抗旱、耐寒、抗倒伏、防病及抗盐碱能力，同时还能有效预防作物生理性病害的发生。
4、提高化肥利用率
微生物菌肥有效菌大多能分解土壤中有机质，有机质分解过程中生成腐殖酸，腐殖酸与土壤中的氮形成腐殖酸铵，可减少氮肥的流失。解钾溶磷有效菌能将土壤中固化的化学钾肥、化学磷肥分解转化为速效钾、速效磷，提高其利用率，降低生产投入，减少资源浪费。
5、改善土壤养分
微生物菌肥有效菌能够促进土壤中难溶性养分的溶解和释放，提高土壤养分的供应能力。有效菌所分泌的胞外多糖物质，是土壤团粒结构的粘合剂，能够增强土壤团粒结构，疏松土壤，提高土壤通透性和保水保肥能力，增加土壤有机质，活化土壤中的潜在养分，改善土壤中养分的供应状况。