不断变异产生更具有传播性或致病力的新毒株是新冠大流行得以持续，并给世界带来严重灾难的主要原因之一。
一般认为，新冠病毒的变异以点突变为主，重组变异发生率较低，但重组变异体有可能产生出更具有传染性和致病力的毒株。
重组变异被定义为两种不同病毒变异体之间的遗传物质交换，会导致具有新特征的新变异体的产生。
到目前为止，已经确认α和δ变体，δ和o（奥密克戎），以及奥密克戎亚系BA.1和BA.2重组变异体。
其中，由于δ变异体的高致病性，o变异体的高传染性和免疫逃逸能力，delta-omicron重组产生的新变异体预计可能产生更“坏”的变体，对疫苗和治疗有效性的潜在影响也可能更大，因而更受人关注。
在此之前，δ—o重组事件已经在英国和法国被确认。
但是，有人认为这些重组变体可能是由实验室污染、测序错误或共同感染造成的。
美国CDC国家新冠病毒毒株监测计划，目的是识别、表征和监测新冠病毒的新变种。该计划迄今已从美国鉴定出180万个新冠状病毒基因组。
科学家从这180万个新冠状病毒基因组中经过复杂的检测，共鉴定出了9个delta-omicron重组序列。
分析发现，这些重组序列同时包含δ和o变异体的特征突变，尤其是刺突蛋白氨基酸158和339序列之间从δ相关突变变为ο相关突变。
图中，橙色代表Delta变体相关的氨基酸取代，紫色代表Omicron变体相关的氨基酸取代；色调对应于含有Omicron或Delta相关序列的比例。灰色框表示Omicron和Delta序列共有的氨基酸取代；白色框表示相对于最早原始毒株没有变异，黑色框则表示对于Delta或Omicron序列总体上都不常见的取代。
为了排除重组体来自实验室污染或测序错误的可能性，科学家利用各种测序策略对已识别重组序列的原始数据进行了反复阅读，确认重组来源于自然感染。
此外，科学家在预测的重组位点内的特定位置将重组序列片段化。通过将片段序列与delta和omicron变体的参考序列进行比对，观察到第一个片段属于delta分支，其余片段属于omicron分支。
进一步的测序分析还证实，在重组变体中，特征性的δ突变与不同的ο突变同时发生。
而这些基因翻译的刺突蛋白也显示出包含来自delta和omicron变体的特征性氨基酸的杂合序列。
总之，科学家经过复杂的检测，反复确认在美国发现的9个delta-omicron重组序列。
尽管，检出这些重组变异体的美国地区病例数并没有显著增加，因此，这些重组变异体到目前为止，可能并未对疫情造成显著影响。
当然，科学家也承认，由于缺乏检测包含这些重组基因组的识别信息，目前还不能确定其与流行病学的联系。
鉴于重组变异体对公共卫生潜在的影响，科学家们建议对新的重组变异体进行连续的基因组监测，以快速检测和监测。