随着邪恶力量的滋生壮大，灰袍巫师甘道夫开始心生疑窦，担心这其实是索隆卷土重来的征兆。于是，第三纪元2063年，他斗胆亲自闯入多古尔都的大门进行调查，但索隆闻风而逃，暂时撤离多古尔都、潜伏到东方，他的身份因此没有败露。此后，中洲获得了很长一段时间的和平时期，史称警戒和平。警戒和平结束于第三纪元2460年，索隆在这一年挟更强大的力量重归多古尔都；为了对抗卷土重来的魔影，智者们随即组建起包括巫师和精灵领主在内的白道会。此时的史密戈也杀死了迭戈，获得了魔戒，而这枚戒指正是索伦一直想寻找的，后来罗斯洛瑞安的精灵也知道了索伦的存在，提高了警惕性。在2510年前后，洛汗人与刚铎曾在战场上结盟并打败了入侵者，但是同时他们也看到了一团白色的迷雾状物体前往多尔多哥要塞，他们提高了警惕性。随后的中土大陆的西方处于异常平静的状态，多尔多哥的势力越来越强大。
第三纪元2841年，流亡的都林矮人之王、矮人七戒的持有者之一瑟莱因二世在途径黑森林边缘时，被索隆的爪牙活捉。他随后被押往多古尔都的地牢，在那里饱受折磨，矮人魔戒也被夺走。但是，瑟莱因二世仍然藏起了两件传家宝：瑟罗尔的地图和孤山暗门的钥匙。他在多古尔都的地牢里苟活了数年，心智崩溃，最后连自己的名字都遗忘了。第三纪元2850年，甘道夫再一次乔装打扮潜入多古尔都调查，他既发现了垂死的瑟莱因、从他手里得到了地图和钥匙，同时终于确认：多古尔都的魔影并非戒灵，正是重新凝聚成形的索隆。
第三纪元2851年，白道会针对甘道夫的发现召开会议，甘道夫力主进攻多古尔都，但议长萨茹曼驳回了他的意见，宣称无需忌惮失去至尊戒的索隆；直到第三纪元2941年，萨茹曼才终于同意进攻多古尔都。据说，多亏了萨茹曼的精心策划，这次进攻得以将索隆成功逐出多古尔都；但是，索隆的撤退其实是有意为之，他此前一直通过九戒灵经营着魔多的大本营。多古尔都刚一失守，他就立刻逃往魔多，并在那里以更强的威势东山再起。
第三纪元2951年，索隆派遣以可哈穆尔为首的三名戒灵再次占领多古尔都。可哈穆尔随后留守此地，作为索隆的副官掌管多古尔都。第三纪元3018年3月，多古尔都的斥候发现咕噜被关押在瑟兰杜伊统治的黑森林王国；6月20日，多古尔都的奥克军队偷袭黑森林王国的西尔凡精灵，从而导致了咕噜的逃脱。
第三纪元3018年 - 3019年的魔戒大战中，多古尔都在北方战场发动数场重要战役，造成了惨重的破坏。第三纪元3019年3月11日、15日和22日，多古尔都的军队对洛丝罗瑞恩森林发起三次袭击，虽然洛丝罗瑞恩边境上的美丽森林遭到了严重毁坏，但三场攻势均被英勇的精灵和加拉德瑞尔的强大力量击退。与此同时，瑟兰杜伊的黑森林王国也遭到多古尔都侵略，林中的战斗持续良久，大火造成了巨大破坏，但最终瑟兰杜伊取得了胜利。至尊戒被毁、索隆败亡之后，洛丝罗瑞恩领主凯勒博恩和加拉德瑞尔率军乘船渡过安都因河，对多古尔都发起反攻。他们占领了多古尔都，加拉德瑞尔推倒它的城墙、摧毁它的地牢，这片黑暗滋生已久的森林终于得到了净化。