1993年，经过福清市文史工作者的努力，终于在东张镇少林自然村找到了南少林遗址。
随着福清南少林遗址的发现，“福清南少林武术是世界南少林武术的发源地”的论断随之提出。1996年福清南少林寺重建以来，新加坡、印尼、美国、日本、俄罗斯、英国、加拿大、法国等世界各国前来福清寻根谒祖的团队和个人不计其数。
2004年，福清市成立南少林武术研究会，会员们深入民间，走访众多老拳师，对多种拳术、兵器、武医进行抢救、挖掘、整理，已整理出福清禅宗拳术、民间拳术（包括器械）套路75种、器械47种、硬气功11种及点穴技艺等，为研究南少林武术提供了宝贵的资料，也证明了福清南少林既有寺又有拳。
特别是已去世的百岁老人张本利，武艺高强，在1936年就获得福清县第二届运动会个人武术总优胜，后担任福清国术馆馆长兼总教练。他能打南少林拳、剑、刀、枪等20多种套路，被称为福建南少林拳的“活化石”。
福清练武之人众多，早在1949年之前，几乎每个乡村都开设武馆传授武术，县城由官方设办福清国术馆，30年间培养了武林名师千余人。福清南少林武术是中华武术魂宝中一朵奇葩，流派中的咏春拳、宗鹤拳已入列福建省非物质文化遗产代表性项目名录。