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谷歌将開放雲平台:欲破解自閉症遺傳密碼

谷歌将開放雲平台:欲破解自閉症遺傳密碼

過去15年來,針對網絡上雜亂無章的資訊,谷歌一直在完善其識别技術。現在,該公司将利用這些專業知識,尋找包含在人類基因組資料海洋中有關導緻自閉症的遺傳線索。

美國自閉症研究公益組織“自閉症之聲”(autism speaks)周二宣布,該組織正與谷歌合作,對1萬名自閉症患者及其家庭成員的基因組進行排序。谷歌将存儲和管理這些資料,并對合格的研究人員開放這些資料。在他們尋找可能為自閉症遺傳根源的變異dna時,可對這些資料進行篩選。

“自閉症之聲”首席科學官羅布·林(rob ring)表示:“我們認為,了解自閉症的線索存在于基因組中。我們希望利用與網際網路搜尋類似的技術和方法,對人類的基因組進行搜尋,進而尋找這些失蹤的答案。”

該項目将利用一個名為“谷歌基因組”(google genomics)的工具,谷歌幾個月前在其雲計算平台上不聲不響地推出了該工具。

人類基因組測序的速度變得越來越快,而價格越來越便宜,羅布•林稱,現在完成一次人類基因組測序隻要花費2500美元,相比之下,當年的人類基因組計劃(human genome project)花費了近30億美元。這使得研究人員産生的基因資料呈天文數字般地增長。通過允許研究人員将資料存儲到其伺服器上,谷歌得以顯示和改進其雲計算的功能,同時為基因組研究提供了一個潛在的重要服務。

“谷歌基因組”工程主管、前google+項目工程主管大衛·格雷澤(david glazer)指出,人類基因組的搜尋不是搜尋關鍵字,研究人員可以搜尋基因組的特定片段及基因組序列,進而找到具有共同變異的基因組片段。因為一個人的基因組可以多達100千兆位元組,讓這些資料存儲在一個中央伺服器中,便于研究人員更容易地開展遠端協作。

“自閉症之聲”總裁利茲·費爾德(liz feld)表示,她強烈希望遺傳分析将有助于研究人員推出更加個性化的治療方法,因為基因組分析讓人們對癌症的不同亞型有更精确的認識。費爾德說:“對我們來說最重要的事情是,這項研究将會讓我們能夠發現和了解各種形式的自閉症。”

自閉症基因組計劃可能是谷歌首次進軍醫療和藥品領域。該公司已瞄準從帕金森症到癌症所有人類目前尚未攻克的病症,而它擁有的技術實力讓它有能力開展基因組學研究。近年來,研究人員已經看到,生物學有助于人們加深對計算方式的了解。畢竟,大自然已經花費了數十億年的時間完善dna,讓其作為存儲和傳輸資訊的最有效方式。

羅布•林表示,“自閉症之聲”自己收集基因組資料已超過了10年的時間。他說,現在,他相信谷歌等公司有能力在這方面做一些有價值的事:“我們意識到,我們一些最大的生物學問題是真正的大資料問題。”

原文釋出時間為:2014-12-11

本文來自雲栖社群合作夥伴“大資料文摘”,了解相關資訊可以關注“bigdatadigest”微信公衆号

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