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解析香菇适應性進化遺傳基礎

解析香菇适應性進化遺傳基礎

香菇 華中農業大學供圖

(記者李晨)近日,華中農業大學植物科學技術學院教授邊銀丙領銜的研究團隊,首次使用群體基因組方法探究了具有重要經濟價值食用菌的進化史,解析了香菇适應性進化的遺傳基礎,研究結果将為香菇優良品種選育提供重要參考依據。相關成果發表于《先進研究雜志》。

香菇是全球最重要的食用菌,産量占世界栽培食用菌總産量的22%,居各種類首位。生态适應和人工選擇都可推動香菇基因組的進化,但其表型—基因型—适應性之間的聯系尚不明确。

研究團隊基于133個香菇菌株,開展了基因組重測序和栽培試驗。群體基因組研究将供試菌株分為3個亞群,亞群間具有顯著的地理分布特征、表型分化和溫度響應差異。3個亞群獨立分化于36871世代以前,現代香菇栽培品種可能起源于我國東北附近地區。

結合基因組掃描和全基因組關聯分析,研究團隊發現了大量與群體間遺傳和表型分化相關的候選基因。其中,環境響應、信号轉導、轉錄調控、細胞周期調控、真菌細胞壁重塑、蛋白質降解以及代謝和運輸相關功能基因尤為重要。結合子實體發育的轉錄組研究發現,相當一部分群體分化相關基因參與了子實體發育的過程。研究團隊建構了香菇适應性進化過程中遺傳和表型分化的模型。研究結果表明,這對當地環境,特别是溫度的适應引發了香菇群體的遺傳和表型分化。

來源: 《中國科學報》