金針菇栽培管理要求較高，特别是子實體發育對水分的要求。現介紹五字經水分管理法，以供參考。
一保當菌絲發到袋底後，立即開袋搔菌，耙去老菌皮，蓋濕報紙或地膜進行保濕催蕾。報紙覆寫的，噴水應少量多次每天3~4次，以保持報紙濕潤；地膜覆寫的，可向地面和空間噴水，保持空氣濕度90%左右，此期每天開窗通風1次，室溫控制在10℃~14℃，經5~7天菇蕾便大量發生。
二降當菇蕾長到1~2厘米，即進入抑制生長時期，此時要減少或停止噴水，降低濕度。連續3~5天夜間打開門窗，讓冷風進入降溫散濕，把室溫降到8℃以下（4℃~5℃最好），濕度降到75%左右，使子實體受抑，生長整齊粗壯。
三促子實體長到3~4厘米，進入伸長期後，每天噴水4~5次。噴水量随菇的增長而增加，掌握空氣濕度在90%左右（即子實體基部袋壁附有細水珠為宜），促進子實體迅速生長。同時适當通風，采取幹濕交替來抑制菇蓋增加和促菇柄伸長。此階段噴水量應根據天氣而定，晴天多噴，雨天少噴，以防因噴水過量而發生根腐病、褐斑病和菇體含水過多而降低品質。切忌将水噴灑到菇蓋上，發現報紙破損要及時更換，報紙上有積水要立即倒掉，防止菇體接觸水滴産生黑斑點，影響商品外觀。
四補菌袋在頭潮菇采收後，含水量下降20%~30%，二潮菇采後下降30%~50%。是以，在第一、二潮菇采收後，要立即向搔菌後的菌袋裡噴水補濕。其做法是：連續2~3天，每天2~3次直接朝袋内噴水，每次以菌柱表面濕潤為宜，不可使袋内積水。為提高産量，可在水中加少量的尿素、白糖、磷酸二氫鉀等，以補充養分。
五浸采收三潮菇後，菌柱的含水量已降到50%以下，此時可脫去塑膠袋，将菌柱置池水中浸泡，待菌柱吸水恢複到原來開袋時的重量時撈起，稍晾幹裝入袋中；也可直接向袋内注水浸泡，待菌柱吸足水後倒淨袋内多餘的水。補足水分後再将菌袋重新排放在床架上，覆寫濕報紙照常管理，這樣還可采兩潮菇。
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