位于下頭裡406号，碑記載至今已有近千年曆史，2019年重新修建。宋微宗末年信衆到安溪清水岩祈請香火，木刻大、二、三祖回香山供奉。明嘉靖王午年（1522年）香山分爐，二祖至清泉岩（後山岩），三祖至普陀岩（獅岩）。宋隆興二年（1163年）欽賜昭應太師，廟前後兩落中天井左右廊道。後落正殿正中供奉三寶佛祖，左清水祖師，右注生娘娘。廊道左右兩側分别奉祀地藏菩薩、閻羅天子、關帝、文昌帝、月老。
寺南林希元書院（艮齋，既山上的書房。），相傳林希元建，林希元（1482年-1567年），字茂貞，号次崖，出生于福建同安縣人山頭村，明正德十二年（公元1517年）進士，先後任南京大理寺評事、寺正、泗州判官、北京大理寺丞、欽州知州、廣東按察司佥事。被時人稱為“泉郡理學三狂”之一，所著“二疑”代表了明代學術水準，明廷賜其“文宗廷尉”，清乾隆改“理學名宦”，明嘉靖年間在同安孔廟西側為林希元建專祠。
寺廟楹聯:
普濟衆生雙獅仰北鬥，陀披德澤鳄魚朝畔江；
普陀岩峯祖師恩澤施八寶，三寶佛光顯赫佑萬民；
山聳普陀界上李楊鮮如許，廟中清水爐前園浦景倍明。
翔安的民俗信仰及古迹11——垵山普陀岩寺、林希元書院（艮齋） 
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