實驗室資料安全保密性是實驗室通用要求，也是實驗室客戶、外部監管機構重點關注的内容。
實驗室保密内容可能是國家秘密、商業秘密或者技術秘密。
通過實驗室資訊化管理系統**LIMS**來設定保密按鈕，確定實驗室資料庫管理系統的安全性。
一，原始記錄和報告的保密
對各項目的檢測原始記錄和檢驗報告，操作員須及時上傳LIMS系統儲存，對外保密。
二，實驗室資料儲存
妥善儲存實驗室資料（特别是技術和檢測相關），不準私自外借，複制，傳送等；按照LIMS程式做好檔案和記錄的保密管理,為儲存的實驗室資料設定系統檔案，随時可查，可以溯源。
\
三，實驗室為客戶檢測資料保密
實驗室在客戶處獲得的，或者在試驗過程中産生的各項檢測資料秘密，需為客戶保密，公開前得到客戶的同意，除非與客戶事先有約定，或者客戶已經公布。在LIMS應用中，在相應的客戶管理子產品，可以針對不同的客戶設定級别進行管理，確定資料安全性。
保密控制
\
業務員在接受客戶委托時， 要詢問客戶對樣品以及技術資料的保密是否有特殊的要求，将特殊要求資訊填寫在委托單上，以便樣品及資料在流轉過程中接觸到的所有相關人員知曉并按照其要求執行。
對于樣品與資料的流轉， 隻允許指定流轉人員接觸，其它人員未經允許不得擅自接觸樣品及浏覽相關資料，因個人行為而導緻的洩密情況将按照本程式内容進行處置。
樣品管理者針對有特殊保密要求的樣品在倉庫存放時應給予充分的保密措施;資料員對客戶所提供資料的存放不可較長時間的脫離其監控範圍，以免為無關人員獲得導緻洩密，客戶的任何資料未經客戶同意，不得外借或無關人員查閱、影印。
四，實驗室人員管理權限設定
設定實驗室人員管理權限，層層管理者保密，實驗室管理者在LIMS系統中進行相應的管理權限設定，不同管理者管理的資料不同，落實保護機密資訊和所有權的各項措施實施所需的資源和責任人，確定不洩露本實驗室的任何秘密。
五，工作崗位的替換
從業人員調離工作崗位，須歸還所保管的一切有關的技術資料，**LIMS系統**做好交接工作，管理者及時更換賬号，密碼等。
以法律要求為準
實驗室依據法律要求或合同授權透漏保密資訊時，應将所提供的資訊通知到相關客戶或個人，除非法律禁止。如食品檢測,實驗室檢測出某 些緻病菌，應直接上報相關部門，而不是告知客戶。
實驗室還可通過以下方式確定保密性
01 人員與實驗室簽訂保密協定，或在勞動合同中展現保密事項。并将所有的合同檔案在LIMS系統中進行管理歸類，并進行相應的電子簽名等[；]
02 對所有人員進行職業道德教育訓練，強調保密的重要性；