和GEO資料庫類似，ArrayExpress是屬于EBI旗下的公共資料庫，用于存放晶片和高通量測序的相關資料，網址如下
https://www.ebi.ac.uk/arrayexpress/
資料來源于下圖所示的兩個部分
第一部分是由科研工作者送出的資料，第二部分是從GEO資料庫自動導入的資料，在該資料庫中，資料以實驗experiments為機關，每個實驗對應一個唯一的編号，如下圖所示
第一列的
Accession
代表每個實驗設計對應的編号，
Assays
表示該實驗對應的樣本總數，
Raw
代表原始資料。目前版本資料量如下
通過該資料庫，我們可以
- 檢索資料，根據關鍵字，編号等查找感興趣的資料集
- 下載下傳資料，基于公共資料進行分析挖掘
- 送出資料，上傳自己的資料到該資料庫中
點選每個實驗編号，可以顯示詳細資訊，示意如下
紅框标記的部分是通常會關注的3個部分，第一部分展示該實驗包含的樣本的詳細資訊，點選之後可以檢視樣本相關的metadata, 示意如下
第二部分用于下載下傳資料，第三部分用于将該結果導入到其他軟體，比如GenomeSpace中進行分析和檢視。
除了下載下傳和分析公共資料集，也可以上傳自己的資料到該資料庫。除了宏基因組/宏轉錄組， 轉錄組組裝的相關結果資料，其他絕大部分資料都是可以上傳到該資料庫的，比如SNP分型，基因表達譜，chip_seq, atac_seq, 甲基化測序等結果都可以。