ERP系統的業務執行流程對不同的軟體系統會有所不同，一般都包含如下流程：
1. 設定ERP系統的基本資訊：主要包括公司資料，使用者資訊，會計科目，物料資訊，倉庫資訊，工作中心，系統運作參數等。
2. 根據産品預測和訂單資料生成主生産計劃，通過粗能力計劃驗證主生産計劃的可行性，并最終确認主生産計劃。
3. 由主生産計劃，物料清單和庫存資訊計算物料需求計劃，物料需求計劃的可行性由能力需求計劃進行平衡，調整，并最終确認物料需求計劃。
4. 由物料需求計劃分别産出采購訂單，生産任務單，委外加工單。
5. 采購訂單由采購管理系統處理，采購材料通過品質檢驗驗收入庫，同時産生應付帳款轉應付帳款系統處理。
6. 生産任務單下達到工廠中的房間，按工藝路線，生成工單，由工廠中的房間安排生産，産品加工過程中要進行品質控制，同時産品生産中的直接材料，直接人工和制造費用轉入本成管理系統進行成本計算和成本分析，最後完工産品驗收入庫。
7. 委外加工單交委外廠商加工，委外加工産品經驗收合格入庫，委外費用計入成本管理系統。
8. 産品完工入庫後，進行銷售出貨，銷售産品産生應收帳款，轉應收帳款處理，銷售資料轉銷售分析系統進行銷售分析。
9. 采購，委外，銷售系統産生的票據，現金轉票據現金管理系統。由應收，應付，成本，票據現金系統産生的帳務均需總帳系統進行帳務處理。
