天天看點

ucsc genome brower的用法和說明(一) - 青萍,你好

ucsc genome brower的用法和說明(一)

官網說明書:http://genome.ucsc.edu/goldenpath/help/hgTracksHelp.html

1.genome brower的作用

a,展示任何尺度的基因組片段。比如,想看某條染色體的某個區域的序列。

b,展示某些位置的annotation tracks。比如,你得到一些區域的深度,你想檢視下這些區域的深度在染色體上怎麼分布的,他們是否有一緻性。

annotation tracks展示在基因組坐标的下方。

ucsc自身帶有一些annotaton tracks,一半來自已出版的文章,另一半來自其合作者。使用者也可以自定義annotation tracks,這邊會涉及到tracks的檔案格式。

2.genome brower的開始

ucsc genome brower的用法和說明(一) - 青萍,你好
ucsc genome brower的用法和說明(一) - 青萍,你好
ucsc genome brower的用法和說明(一) - 青萍,你好
ucsc genome brower的用法和說明(一) - 青萍,你好
ucsc genome brower的用法和說明(一) - 青萍,你好