1949年，上海戰役正打得火熱，參加上海戰役的10兵團司令葉飛接到指令，率部提前解放福建。
福建原計劃在1950年解放，之是以這樣，上級考慮解放軍占領江浙滬，需要鞏固一段時間，然後再對福建、兩廣、大西南進軍。因形勢發展比預期要快，上海、浙江進展都很順利，為此，上級決定提前解放全中國。
1949年5月底，上海解放後，10兵團短暫休整，直接進行入閩準備。上級考慮逃到福建都是殘兵敗将，決定隻調28軍、29軍入閩作戰，葉飛非常了解福建形勢，認為2個軍作戰困難，要求3個軍入閩作戰，最終決定10兵團3個軍一起入閩工作。
在葉飛的指揮下，進行福州戰役、廈門戰役等，福建大部獲得解放。
廈門解放後，因閩南地區人多地少，部隊供給問題不好解決，葉飛要求解決吃飯問題，讓後勤部保證部隊和城市居民糧食供應，從其他部隊調集糧食支援廈門。地方和軍隊工作都很多，葉飛抓全局工作，而此時部隊準備發起金門戰役。
對于金門戰役的作戰，并由二十八軍執行，作戰方案也是由28軍制定。當時軍長和政委都不在部隊，隻有副軍長和政治部主任在，他們制定作戰好方案，上報給葉飛。
從敵人的兵力部署上看，敵人在大小金門雖然有一個兵團，卻隻有2萬餘人的兵力，而且士氣、戰鬥力，都不如一路勢如破竹的解放軍。
還有一份情報擺在葉飛面前，胡琏請求撤回台灣，可蔣介石讓胡琏按照指令執行增援金門的電報沒有擷取到。為此，葉飛認為胡琏可能撤逃，也可能增援，在胡琏沒有抵達金門前，盡快解放大小金門，經過考慮準許28軍作戰任務。
此時，胡琏的部隊已經開始登陸，當28軍幾個團登陸作戰時，他來一個反包圍，切斷登島部隊的後路。因為船隻不足，後續4個團過不了海，無法增援。島上部隊苦戰三天三夜，我軍與島上部隊完全失去聯系，攻金失利，全軍震動。
作為兵團司令員，葉飛要求主動承擔責任，找到三野司令員陳毅請求處分。陳毅說：現在不是處分誰，要接受經驗教訓。
雖然他沒有受到處分，思想包袱很重，他要積極準備，再次攻金門。隻可惜局勢變化，北韓戰争爆發，志願軍入朝作戰。主力部隊被派去前線，葉飛的任務是全力剿匪。
直到1958年，上級準備發起金門炮戰時，讓他成為前線總指揮，也算是彌補一種遺憾。