RDKit入門與進階教程（30篇）

RDKit

RDKit是用C ++和Python編寫的化學資訊學和機器學習軟體集。

項目包含：

BSD許可證 - 開源的商業友好許可證

核心資料結構和算法C++編寫

使用Boost.Python生成的Python 3.x包裝器

使用SWIG生成的Java和C＃包裝器

2D和3D分子操作

用于機器學習的描述符和指紋生成

用于PostgreSQL的分子資料庫 cartridge ，支援子結構和相似性搜尋以及許多描述符

KNIME的化學資訊學節點

Contrib檔案夾中包含有用的利用RDKit強大功能的社群貢獻軟體

RDkit Tutorial

RDKit：計算不同小分子構象之間的RMSD

聚類小分子資料集(基于RDKit的Python腳本)

基于RDKit的Python腳本：SDF格式轉SMILES格式

RDKit：運用RDKit計算USRCAT（形狀相似性）

RDKit：可視化藥效團（Pharmacophore）

基于Pytorch和RDKit建立QSAR模型

RDKit：化合物骨架分析

RDKit：化合物相似性搜尋

基于RDKit的溶解度預測的機器學習模型

基于機器學習的化合物活性預測模型

RDKit：化合物亞結構（Substructure）搜尋

基于神經網絡的溶解度預測和回歸分析

基于RDKit探索DrugBank（demo）

基于随機森林的化合物活性二分類模型

RDKit支援PostgreSQL配置

RDKit：基于支援向量回歸（SVR）預測logP

基于随機森林（RF）的機器學習模型預測hERG阻斷劑活性

RDkit＆mol2vec ：靶标抑制劑活性二分類模型對比