一、Open Babel簡介
Open Babel是一款開源自由軟體,使用Open Babel可以将一種化學結構類型的檔案格式轉換成另一種檔案格式,非常友善的進行各種類型的化學結構檔案進行互相轉換。
Open Babel由CC++編寫,并提供C ++, Perl, Python等的API接口友善開發。
二、Open Babel 2.4.1的編譯安裝并綁定Python
第一步:下載下傳openbabel 2.4.1安裝包
下載下傳位址:
https://github.com/openbabel/openbabel/releases點選打開連結
第二步:安裝boost庫
yum install boost
yum install boost-devel
yum install boost-doc
第三步:安裝gcc、g++、mke\cmkae
yum install gcc
yum install gcc-c++
yum install make
yum install cmake
第四步:安裝依賴的開發庫
yum install zlib-devel
yum install libxml2-devel
yum install cairo-devel
Eigen庫安裝,直接下載下傳Eigen2和Eigen3版版本解壓至usr/local/include
http://eigen.tuxfamily.org/index.php?title=Main_Page第五步:支援Python(Python2.7)綁定,安裝python開發庫
yum install python-devel
第六步:編譯安裝
tar zxvf openbabel-2.4.1.tar.gz
mkdir build
cd build
cmake ../openbabel-2.4.1 -DPYTHON_BINDINGS=ON #編譯安裝Python綁定
make
make test
make install
第七步:配置環境變量
gedit ~/.bashrc
#open babel
export PATH=/usr/local/bin:$PATH
export LD_LIBRARY_PATH=$LD_LIBRARY_PATH:/usr/local/lib
export PYTHONPATH=/usr/local/lib/python2.7/site-packages:$PYTHONPATH #Python路徑添加
source ~/.bashrc
最後一步:
檢查Open Babel 2.4.1和Python綁定是否安裝成功
檢查Open Babel 2.4.1

Python綁定是否成功