大資料領域的新面孔！我國微生物大資料平台獲得國家大力支援

近日，中國科學院微生物研究所微生物資源與大資料中心、世界微生物資料中心團隊題為World Data Centre for Microorganisms: an information infrastructure to explore and utilize preserved microbial strains worldwide 的研究論文被國際學術期刊《核酸研究》（Nucleic Acids Research）線上發表，微生物資源與大資料中心、世界微生物資料中心主任馬俊才為本文通訊作者。

我國微生物大資料平台建設獲進展

微生物作為最簡單的生命體成為生命科學研究不可替代的基本材料，微生物資料是微生物資源共享和開發的關鍵環節，資料資源的豐富性、準确性和共享水準決定着整個微生物學領域研究和應用的綜合能力。世界微生物資料中心（World data center for microorganisms, WDCM）隸屬于國際生命科學聯盟（IUBS）下屬的世界微生物菌種保藏聯合會(WFCC)和聯合國教科文組織（UNESCO）下屬的國際微生物資源中心（MIRCEN），由世界菌種保藏聯盟在上世紀60年代建立，是全球微生物領域最重要的實物資源資料平台，也是我國生命科學領域唯一的一個世界資料中心。

在該研究中，團隊以世界微生物資料中心為平台倡導全球微生物菌種保藏目錄（Global Catalogue of Microorganisms，GCM）重大微生物資料資源國際合作計劃，為分散于全球各個保藏中心和科學家手中寶貴的微生物資源提供一個全球統一的資料倉庫，并以統一資料門戶的形式，對全世界科技界和産業界提供微生物菌種資源的資訊服務。目前已經有來自美國、法國、德國、荷蘭等43個國家和地區的107個國際微生物資源保藏機構正式參加這一計劃。

在大資料整合技術研究方面，團隊開發了生物資源引用平台系統，利用先進的資料挖掘手段，從全球超過600萬已發表的微生物文獻、專利、核酸序列和基因組中，進一步提取了微生物資源的後續研究和利用的資訊，并開發了參考菌株目錄，作為一個跨平台參考目錄，整合ISO以及其他國際标準菌種統一編号，推動了全球菌種資源的高标準應用。該資料平台對于微生物實物資源從采集、保藏、跨國轉移、學術和商業應用以及利益分享的各個環節都能提供有效的資料支援，為《名古屋議定書》在微生物領域的實施和執行提供最重要的支撐。平台及其相關的指導原則，是國際上第一次形成一套完善的可運作的資訊平台方案。WDCM在CBD/NP實施方面的相關工作，也符合我國參與CBD工作的主要方向。

微生物大資料平台目前已經處于穩定的運作和服務階段，在資料內建和服務機制上，也進行了積極的探索，使得該平台能夠有效地在全球範圍進行資料資源的內建，并實作可持續發展。同時，WDCM作為一個合作平台，使我國科學家能夠在全球的角度，組織和協調各國的相關力量，建立全球性的合作架構，也讓中國有機會逐漸在微生物資源的開發應用和資料共享方面占領國際微生物研究前沿和主導地位。截至目前，平台的累計通路次數已超過20萬次。

該研究得到國家“863”計劃《微生物數字化資訊系統內建關鍵技術研發》、中科院資訊化專項微生物領域雲、中科院科技促進發展局《世界微生物資料中心建設》等項目的支援。

本文出處：暢享網

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