正德以來軍匠數量不斷膨脹，對京儲的消耗日益增多，它所帶來的弊端也日漸明顯。世宗即位之初，開始清除正德以來的弊政。
針對正德時期，京師軍匠數量膨脹的情況，朝廷逐漸裁汰軍匠，并取得了成效。如世宗即位之初，裁革錦衣衛官校及勇士匠作人等至十餘萬，歲省京儲米百五十萬石。
嘉靖初年，對正德以來軍匠的裁汰，使得弊源頗清，這與世宗力求清除正德弊政的态度，有着莫大的關系。但是，随着時間的推移，清除正德弊政，裁汰軍匠的舉措并沒有徹底進行下去。
世宗的态度很快發生了轉變，開始對内府監局濫收軍匠的現象，視而不見，甚至在某種程度上給予支援。不久就出現監局未及兩月之間，收充軍匠三千七百餘人，歲支食米及冬衣布花數多的局面。
嘉靖四年三月，禦用監太監黃錦以工匠不足為由，請求增設二千名工匠供役，世宗不顧兵部的反對，仍命選五百名應用，而嚴私役虛冒之禁。世宗的放任，遭到給事中鄭自璧的反對，他提出然弊革而不能久，與不革同，請求世宗繼續裁汰内府監局的工匠，但世宗并未理會。
同年七月，兵部尚書李钺因反對織染局收用匠役，而上疏世宗。李钺曆陳軍匠冗食的弊端，分析了軍匠與糧儲，糧儲與國脈的關系以及京儲的消耗，對京師的影響，請求世宗有所行動。疏入，世宗不僅沒有裁汰冗食軍匠，反而仍準許司設監、兵仗局招收五百名工匠，其他監局從宜量收。
同年九月，内府各監局請求招收人匠，得到世宗準許，其招收人數多者數千，少者數百人，遭到各部大臣及言官的強烈反對，但世宗不予理會。
于是，戶部尚書秦金上疏：錢糧為國家之命脈，其盈縮系安危，輸納出小民之膏，其緩急系休戚。各監局軍匠，見在食糧上工數亦不少，兵部尚書李钺等人亦上書世宗，反對監局奏讨軍匠，然而，世宗置之不理。
從世宗即位之初，裁汰正德冗濫軍匠，到此時對内府監局招收軍匠的默許，這種看似前後相悖的舉措，與世宗态度的轉變關系密切。關于世宗态度發生轉變，主要有兩個方面的原因。
第一，武宗死後，世宗以藩王入繼皇位，在其即位之初，就圍繞繼統繼嗣等問題，展開了大禮儀之争，最終雖以世宗欽定大禮而結束，但這次事件讓世宗認識到拉攏内臣，扶植親信的必要性，也使得對宦官的态度發生變化，其中之一表現為，對宦官招收的工匠請求采取默許的态度。
第二，内府監局的軍匠主要是為皇室服務，軍匠的招收于皇帝而言，能夠更好地完成匠役，以滿足自己的需求。這兩方面的因素，促使世宗的态度發生了轉變，而世宗态度的轉變則影響了京師軍匠的裁汰。
正德、嘉靖以來，對軍匠裁汰的主要原因在于，京儲消耗嚴重，增加朝廷負擔。除此之外，還有因冒支月糧、技藝不通等原因而被裁汰。朝廷在裁汰軍匠的同時，也着手清查現有的食糧軍匠，由于軍匠逃亡以及匠役銀制度的推行，朝廷也會适量雇募軍匠。
如嘉靖二十六年，工部給事中黃宗概，請求朝廷清查各監食糧軍匠，凡多餘者悉撥赴工所，如或不足方準雇覓。黃宗概提出建議的主要目的是，為了節省國家的财政支出，加之其建議可行，因而得到了世宗的準許。
嘉靖以後，在相關的史料中很難發現，軍匠藍瘦和大臣上疏，請求裁汰軍匠的記載。這與嘉靖及其之前的原有社會體制，所受到的沖擊密不可分。明朝統治者為了便于管理軍籍人員，對軍籍人員的數量采取的是一種保守态度，既不失原額。
正德、嘉靖時期，軍匠的投充現象十分嚴重，在投充者中有很大一部分，是非軍匠籍人員，他們的投充意味着對以職業劃分戶籍制度的破壞，和對現有軍匠體制的沖擊。朝廷裁汰軍匠的措施，也是在試圖維持不失原額的局面，但并不能夠阻擋明朝末年整個社會體制的震蕩。
社會流動的加快以及商品經濟的發展，使原有制度受到沖擊，到了嘉靖以後，軍匠大都由雇募而來，原應承擔差役的軍匠也被允許納銀代役，軍匠裁汰的現象很少出現。
總之，軍匠的招收與裁汰和統治者的态度，有着很大的關系，武宗的放任态度，導緻正德年間軍匠數量膨脹，世宗登基後，逐漸裁汰軍匠并取得成效，後由于世宗态度的轉變，導緻軍匠再次過度招收，但尚未達到正德時期軍匠數量膨脹的程度。
到了明朝末期，随着社會流動的加快，匠役銀制度的推行，以及資本主義萌芽的出現，軍匠大部分是由朝廷雇募而來，軍匠的數量較為穩定，很少出現裁汰軍匠的現象。