武德七年六月，李渊带着李世民和李元吉在仁智宫避暑。仁智宫位于离长安城三十多公里的玉华山凤凰谷中，武德七年五月开建，六月完工。一个月就能建成的离宫肯定不会多么奢华，但是李渊却郑重其事的带着李世民和李元吉两位军界大拿前去视察，可见此宫的用处并不单纯是避暑，而是备战。当时突厥猖獗，不知何时就会忽然兵临长安城下，李渊未雨绸缪，在山谷中建了一座离宫，就是为了一旦发生紧急状况可以有个临时避难所。就在此时，李建成的两位亲信尔朱焕和桥公山急匆匆跑了进来，向李渊汇报了一件事，李渊听了又惊又怒。
李渊出来避暑，长安城一切军政事务交给太子李建成全权处置。李建成派两位亲信向曾任东宫守卫的嫡系将领庆州总管杨文干送了几车盔甲，并让他往长安送一批人过来。两亲信半路一商量，这事水很深，搞不好就会掉脑袋，正好出了长安城离仁智宫不远，赶紧过来报告了李渊。李渊找来李世民一商量，李世民说，这是赤裸裸的造反啊。趁着咱们不在长安城想搞事。但是李元吉说，这事还是把我大哥叫过来问一问比较好。是不是造反一问不就清楚了么。李渊说也对，就派人去叫李建成。但并没说杨文干的事，而是随便找了个借口，比如我们想你了让你过来观山景之类。
李建成很快带着大队人马来了，把人马安顿在玉华山下，带了亲随一百多人进了仁智宫。进来一看气氛很沉重，李渊一脸怒容，李世民幸灾乐祸，李元吉患得患失，顿感不妙。果然李渊问起了杨文干的事，李建成舒了一口气，这事能说明白。我为了增强皇宫守卫，向杨文干要了几个人。顺便给他送了几幅盔甲作为奖励。李世民此时才发现自己有点高兴的太早，因为李建成说的天衣无缝毫无破绽。第一，杨文干的人还没来长安城，具体他们是来造反的还是勤王的不好说。第二，李建成作为太子留守京师，有向杨文干要人的权力。
可是李世民说，此事不能刚听我哥一面之词，得把杨文干也找来，具体要人是干啥的对质才能明白。李渊一听也对，就把李建成暂时软禁起来，毕竟他的造反嫌疑还没解除，派李元吉亲信宇文颖去庆州找杨文干过来。结果宇文颖去找杨文干的时候出了岔子。按照正常工作流程，宇文颖只能跟杨文干说李渊让他去一趟，别的啥都不能说。可是他却跟杨文干说了李建成被软禁起来的事，于是杨文干造反了。照杨文干看来，李世民已经提前动手，把李渊李建成李元吉都控制了，就等他自投罗网。其实此时杨文干的反应很正常，李世民玄武门之变后，罗艺和李瑗也是这么反应的。
可惜杨文干错误判断了形势，一切不是他想的那样。杨文干造反以后，李建成就被动了，他的造反嫌疑就坐实了。既然你说你跟杨文干是清白的，为啥杨文干要造反。你们之间肯定有不可告人的秘密。李渊马上下令，李建成严加看管，李世民前去平叛，临行跟李世民说，你把杨文干造反的事搞清楚了，太子位置就是你的。因为如果杨文干和李建成坐实造反的话，李建成也就跟太子没啥关系了。此事合情合理，李世民高高兴兴收拾杨文干去了。活捉杨文干，搞掉李建成。可是刚走半路，杨文干就被部下杀了。李世民再次猪吃尿泡空欢喜一场。
杨文干死无对证，只能李建成说啥是啥。毕竟李建成只有造反嫌疑，却没有确实证据。也就在此时，李建成的队友们也没闲着，李元吉赶紧跟李渊后宫四妃通气，让她们吹枕头风。然后李渊亲信裴寂封伦也来了，力保李建成没有谋反。可惜的是此时李世民还在征讨杨文干的路上，对此一无所知，等他返回长安，才发现形势向着不利于他的一方面发展。自己太有点得意忘形了。收拾杨文干这事根本不用亲自去，随便派个人就能搞定。自己应该守在李渊李建成身边防止闲杂人等靠近。
接着李渊召集裴寂封伦萧瑀陈叔达李建成李世民等人开会，给杨文干事件定性。杨文干造反事件是他的个人行为，和李建成无关。可是他的造反却是由于李建成和李世民内斗引起。正是由于李建成和李世民不和，才导致杨文干为了自保不惜铤而走险。李建成有错，他的谋臣王珪难辞其咎，流放。李世民有错，他的谋臣杜淹（就是杜甫爷爷）难辞其咎，流放。两人各打五十大板，杨文干造反案就这么不了了之了。
那么此案李建成是无辜的吗，也不是。他向杨文干要人，的确不是想造反，而是想充实东宫的保卫力量，为即将到来的和李世民决战做准备。当时太子府秦王府齐王府都在养死士，都在培训杀手刺杀对方重要人物，尉迟恭就被李建成的杀手刺杀过。李建成曾经培训过三百突厥悍勇，准备袭击秦王府，结果李世民先下手为强，去李渊那里把他告发了。李渊对突厥深恶痛绝，勒令李建成把三百人解散了。杨文干所在的庆州位于今日甘肃省庆阳市附近，当时是防备突厥的最前线。李建成让他秘密训练一批人，抽空送到长安东宫来。现在李渊不在了，李世民不在了，正是时候，于是连盔甲都送过去了，让这帮人穿了盔甲进东宫。没想到他派去的两个亲信半道把这事汇报了李渊，一切就此引起连锁反应。