在大多数人的心目中，第三只眼只存在于神话故事中，比如《西游记》中的第二只眼神。其实，第三只眼的概念由来已久，在东方的一些宗教仪式中，人们在眼睛之间画出第三只眼睛，以为可以直接与神交流。
希腊古生物学家奥尔维茨（Olwitz）在研究穿山甲头骨时，发现其中两个洞上方有一个小洞，这些洞按字面排列排列，这一现象引起了他的兴趣。经过大量研究，他认为这个洞是一个退化的眼窝。这一发现震惊了整个生物界，来自不同国家的生物学家加入了这项研究，发现爬行动物，鸟类，鱼类，两栖动物甚至人类都有三只眼睛。古人类学家Belov认为，第三只眼睛的退行性痕迹保留在大脑丘脑的上部，丘脑是一种类似于松果体的不对称器官，称为松果体。
第三只眼睛大多出现在胚胎发育的第二个月，即光敏体和神经细胞形成的阶段。莫名其妙地，第三只眼睛一出现，就开始恶化。根据著名的赫克尔生物基因定律，胚胎在很短的时间内经历了其物种的整个进化历史，也就是说，人类在胚胎时期可以表现出祖先的一些形态特征。但很快，这些器官就会退化，然后不复存在。
新西兰的斑点楔齿蜥蜴已经在地球上存在了2亿年，它们的头骨上有微小的眼窝，在透明的薄膜下隐藏着一只真实的眼睛。古生物学家发现，许多已灭绝的爬行动物头上都有第三只眼睛，正是由于这种独特的器官，爬行动物对地震、火山和磁暴等自然灾害敏感。
如果动物的第三只眼睛可以充分利用它，那么人类的第三只眼睛会做什么呢？
古人类学家别洛夫认为，古代先知眼前出现的奇怪图像是松果糖的作用。当大脑第一次从宇宙中收集能量并保持身体和地面直线振荡时，松果体体验从宇宙中获得非凡的想象力，并将其转化为到达丘脑下部的神经冲动。当这些信号进入视网膜时，会出现一个虚拟图像，然后继续以神经紧张的方式到达大脑的视觉皮层，从而产生意识。
在旧石器时代，一种称为脑环锯的宗教仪式也很流行，进行脑环锯的人往往是祭司的候选人，他们的头是从不同形状的洞中挖出来的，一些专家认为这是为了让宇宙的神秘力量进入松果体变得不那么困难。
虽然许多科学家认为松果体字形是第三只眼睛，但尚不确定它是否具有特殊功能。来自圣彼得堡的生物学家研究了松果体，发现神秘的腺体在性成熟之前起着非常重要的作用，但从那时起，它的作用形式发生了巨大变化。结果，有些人甚至认为松果果和阑尾一样无用。
看来，要真正理解人类神秘的"第三只眼睛"，可能还需要科学进步。