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Mol Plant | 海南大学罗杰团队构建水稻全生育期代谢调控网络

Mol Plant | 海南大学罗杰团队构建水稻全生育期代谢调控网络

责编 | 王一

植物作为固着生物,在其生长发育过程中会积累大量的代谢产物,以适应不断变化的环境和各种胁迫。水稻(Oryza sativa L.)是世界上最重要的作物之一,目前许多研究都集中在对特定组织的分析上,但对水稻整个生命周期代谢物的动态变化还没有阐明。

近日,海南大学罗杰教授团队在Molecular Plant在线发表了题为Rice metabolic regulatory network spanning its entire life cycle的研究论文。该研究利用代谢组和转录组联合分析,构建了水稻全生育期主要组织器官的代谢调控网络并精准识别了调节关键代谢产物积累的调控基因。该研究不仅对水稻基础研究和育种实践具有重要意义,并对其他作物全生育期代谢组学研究提供借鉴。

Mol Plant | 海南大学罗杰团队构建水稻全生育期代谢调控网络

该研究使用籼稻品种珍汕97和明恢63整个生命周期不同组织的样品,结合靶向和非靶向代谢组学分析方法,共有825种代谢物被注释并定量分析。结合代谢组和同一时期的转录组数据构建了水稻代谢调控网络(RMRN)。

Mol Plant | 海南大学罗杰团队构建水稻全生育期代谢调控网络

Figure 1. Schematic Representation of the Design for the RMRN.

利用这个数据集,该研究成功使用两种独立的策略剖析了新的代谢途径,分别是利用已知的转录因子作为诱饵来筛选木质素代谢新的调控网络,以及根据组织特异性无偏见地识别新的甘油磷脂代谢调控因子。因此,该研究通过多组学手段对水稻全生育期进行了全面的代谢谱分析,其大数据资源也将促进水稻生长调控、抗性和营养品质方面的改良研究。

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Figure 2. Analysis of Metabolic Variation in Different Tissues or Organs Using TripleTOF 5600+ LC-MS/MS.

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Figure 3. OsDREB2A Controls Glycerophospholipid Metabolism by Regulating OsPLAIVα.

海南大学罗杰教授为该论文的通讯作者,华中农业大学生命科学技术学院博士研究生杨陈坤为第一作者,博士生沈双欠、周申、李宇飞共同参与了该研究。海南大学王守创教授、华中农业大学陈伟教授、曲良焕副教授和德国马普研究所Alisdair R. Fernie教授等共同参与了该项研究。

原文链接:

https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S1674205221004111

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