传染病是由各种病原体引起的能在人与人、动物与动物或人与动物之间相互传播的一类疾病，当传染源、传播途径以及易感者同时存在并相互作用时就可能导致疫情的发生与扩散。重大传染病疫情是指某种传染病在短时间内发生、波及范围广泛，出现大量的病人或死亡病例，发病率远远超过常年发病率水平的情况。
疫情发生后，卫生部门往往会从疫情事件发生时间、危害范围以及防范风险等方面来界定重大传染病疫情，并依据疫情的危害程度采取相对应的应急措施。
综合分析传染病扩散规律，重大传染病疫情主要特征可概括如下：
（1）持续时间长。传染病主要由各类病菌或病毒引起，通过动植物传播进行传染与扩散，相比较于自然灾害及人为灾害，传染病的扩散更具有潜伏性，由于病毒不易发现，人们对于传染病的认定往往较为缓慢。而传染病毒极易变异和扩散，对于病毒致病机理及预防疫苗的研究往往需要花费较长的时间。
（2）扩散范围广。区别于自然灾害或人为灾害往往发生在特定区域范围的特点，重大传染病疫情具有高度的扩散性，且扩散区域及扩散强度无法提前进行预估。当传染病流行的三个要素同时存在并且相互作用的情况下就有可能导致疫情的发生与扩散。由于扩散的不确定性，全球化背景下人员流动与跨境运输等活动更加频繁，也会进一步加速疫情在国际范围内的传播和扩散。
（3）危害程度高。重大传染病疫情往往具有高致病率和死亡率，严重威胁人们的生命安全，受疫情限制，人们的日常出行和企业生产活动无法进行，社会经济发展滞患，同时社会不安定因素增加，社会矛盾可能进一步激化，国家政治安全也将受到威胁。传染病应急救援对医疗水平要求较高，对于经济发展落后、人员高度密集的国家和地区来说，传染病疫情的爆发将可能造成严重后果。
（4）防控难度大。重大传染病疫情往往具有较长的潜伏期，随着感染人数的逐渐增加，处于潜伏期的病人数量则可能与之成倍数的增加，疾病的排查、检测与防控需要消耗大量的人力、物力与财力。同时随着现代交通运输快速发展，人员和货物流动更加频繁，将加速疫情的扩散。病毒本身具有高变异性，传染病的治疗方案以及预防疫苗的研发方案都会随着变异病毒的致病机理等产生变化。
应急物流是指为了应对严重自然灾害、突发性公共卫生事件、公共安全事件及军事冲突等突发事件而对物资、人员、资金的需求进行紧急保障的一种特殊物流活动。结合传染病疫情的应急特点，传染病应急物流是以满足传染病应急救援为目的，涵盖应急物资储备、征集、调运、分配等物流过程，对传染病防控救援过程中产生的应急物资需求进行的综合性物流活动。传染病应急物流具有突发性、时效性、不确定性、弱经济性以及高可靠性等应急物流的基础特征，但与常见的灾害类应急物流相比也有其特殊性，本节对此概括如下表 2-1 所示。
从应急目标来看，突发事件应急物流的共同目标都是快速及时响应，最大限度的挽救人民生命，但由于传染病具有高度的扩散性，其应急救援除了挽救人民生命之外，更需要对传染病的扩散进行有效控制；从物资种类来看，传染病应急物流主要以医疗物资为主，在隔离等政策约束下可能涉及居民日常生活物资的保障；从物资需求来看，传染病物资需求与其扩散规律有关，呈现明显的先上升后下降的动态性规律，其预测难度往往较大。
而自然灾害物资需求与受灾人数相关，需求波动较小，预测难度较小；从影响范围来看，传染病依赖个体传播，其扩散范围较为广泛且难以预测，自然灾害的发生和影响区域较为固定，灾害扩散性较弱，其影响范围相对于传染病来说要小得多；从持续时间和救援阶段来看，重大传染病防治依赖于长期的有效防控措施与大范围的疫苗接种，而较长的持续时间和传染病的高度扩散性也导致了传染病的应急物流决策往往呈现出动态性和多周期的特征。而自然灾害的应急救援除了灾后的设施重建外，其初期救援和设施修复的持续时间往往较短，调度往往只涉及单周期或少周期。
传染病应急物流的主要目的在于保障应急医疗物资的快速供应，最大限度减少感染者及死亡者数量，有效防控疫情扩散。传染病应急物流的运作过程涵盖应急准备、调度实施和方案评估三个主要阶段，其中传染病应急物流环节的具体实施过程包括应急组织设立、物资需求分析、应急物资筹措、应急物资储备及调度、应急方案效果评估以及结果反馈等。传染病应急物流运作流程图如图 2-1 所示。
传染病应急准备阶段包括应急组织设立、物资需求分析以及应急物资筹措三个主要过程。传染病疫情发生后，政府相关部门应立即成立疫情应急指挥中心，负责传染病应急防控和应急物资保障等相关工作的开展和推进。指挥中心根据各地上报的疫情数据，分析疫情扩散规律，初步预测各疫情发生区域所需应急医疗物资种类及数量，结合疫区实际感染与伤亡情况、应急方案实施的反馈情况以及现有的医疗物资储备情况等，制定应急医疗物资的筹措方案。在物资筹措过程中，根据实际情况可选择动用政府储备、突击生产、物资采购、接收社会捐赠以及征收征用等措施，保障物资的足量供应。
传染病应急实施阶段主要包括应急医疗物资在各级物资供应节点、中转节点、储备节点以及需求节点之间的物资调度过程。为了保障应急医疗物资的快速、及时调度，应急指挥中心应根据现有的应急物资供需数量、车辆运力情况、节点处理能力、运输时间及距离等相关信息，对应急设施选择以及各级调度节点之间的运输方式选择、物资分配和调度数量、物资装载和车辆派出顺序、车辆运输及配送路径等进行综合决策，保证疫区应急医疗物资的需求满足和快速响应。在应急医疗物资调度方案确定后，指挥中心需立即开展物资调度工作，在此过程中应做到实时的监控与反馈，根据实际疫情变化对应急调度方案进行实时调整与更新，保证应急医疗物资的高效、快速与及时调度。
传染病应急评估阶段是指挥中心在应急物资调度过程中需要进行的重要工作之一，对于应急准备和应急实施阶段的相关工作进行评估可以及时发现应急工作的盲点与不足，为下一阶段进行应急工作提供指导，从而保障应急工作的科学性和合理性。同时，传染病应急物流通常会涉及到多类物资、多方参与、多部门管理及多维节点等多重因素，其应急决策非常复杂，应急过程中也可能出现物资、运力、处理能力等不足的情况，因此需要对每一调度阶段后的应急结果进行统计分析，并将相关信息反馈给应急指挥中心，应急指挥中心根据应急物资调度系统反馈信息以及新上报的疫情信息，开展新一轮的应急工作，直至疫情结束。