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胭脂红透明孢子虫在多基因系统中如何发育和分类?一、前文根据现有的序列数据,证据表明至少有六种透明质孢子虫出现在豆蔻属上,

作者:喵爪说

胭脂红透明孢子虫在多基因系统中如何发育和分类?

一、前文

根据现有的序列数据,证据表明至少有六种透明质孢子虫出现在豆蔻属上,其中大多数通常被归类为齿状孢子虫。 

根据其类型宿主的序列,将齿状孢子虫、小豆蔻孢子虫-乳酸孢子虫科、齿状孢子虫-大叶孢子虫、马雷孢子虫和金花孢子虫组合成透明孢子虫,并清除其界限。

宿主物种的范围被证明具有高度诊断性,其宿主范围没有重叠,但物种通常不能仅通过形态来区分。

二、异质实体的分类

最近的分子系统发育研究表明,由感染芸苔科、芸苔科和接合子科的物种建立的透明孢子虫属具有很高的生物多样性,其物种通常具有高度的特异性,已经倡导的狭义物种限制已被证实,反驳了广泛应用的概念,他们将芸苔科的所有种质归类为一个物种,“寄生虫。”

虽然总的来说,狭义物种概念已被证明更合适,但在细节上存在许多问题。根据细微的形态差异和通过交叉接种研究获得的高宿主特异性证据,描述了来自芸苔科的许多物种。

由于交叉接种研究只能在非常有限数量的宿主上进行,他的大多数物种主要基于宿主范围,并结合分生孢子大小和形状的细微差异。

三、胭脂红属和金莲属透明质孢子虫种质的分生孢子

由于上述原因尚无法做出命名决定的有问题的分类群中有五个是齿状孢子虫、豆蔻孢子虫、齿状假单胞菌-大叶假单胞菌、马利假单胞菌。

为了澄清这些命名的不确定性,最近收集了豆蔻描述的所有四种物种的类型宿主。对来自胭脂碱的多种种质对四个基因进行测序和分析,以评估宿主范围和物种边界。

从感染的叶子下面取出分生孢子,在载玻片上转移到无水乳酸中,用镊子和针头小心地撕开,用酒精燃烧器加热并用盖玻片覆盖,显微镜检查和拍摄载玻片,测量值在括号中报告为最大值和最小值,括号中报告为许多测量值的平均值正负标准差。

实验显示所有分子特征都是无序的,并且被赋予相同的权重,在将差距视为缺失数据的情况下进行分析。

具有一千个重复的自举分析以相同的方式进行,但在每次自举重复期间使用5轮随机序列添加和随后的分支交换。

小豆蔻-小豆蔻、马利红细胞和齿状芽孢子虫各仅含有来自单一宿主物种的种质,而在豆蔻-乳酸蝾螈科中,放置了来自几种宿主物种的硬豆蔻和金花苣苔属种质。

在齿形红藻和金针菇中,根据宿主物种在组合分析中观察到一些亚结构,表明物种内存在宿主特异性谱系。在齿状人科分支中,来自七叶桔梗和五叶桔梗的种质形成了高度支持的单门,后者再次形成高度支持的亚支;然而,种质不包含在单系谱系中。

作为分子系统发育研究的结果,小豆蔻-乳酸假单胞菌科、齿状芽孢子虫、齿状假单胞菌-大叶假单胞菌、马利假单胞菌和金花假单胞菌-水生假单胞菌组合成透明质孢子虫。

感染通常为全身性感染,更罕见为局部感染,当全身性全株或叶片发育不良、绿化、矮化时,局部感染产生多角至融合的病变,无明显边缘。下发白,由分散的分生孢子组成,致密而有毛毡状,栖息地在芸苔科的活叶和茎上。

在综合分析中,主要物种分支的分辨率和支持得到改善,被选为高等动物的条形码位点,并被认为是生物体的主要条形码标记,除非证明不合适,也被证明是卵菌的合适条形码位点,这在当前的研究中得到了证实。它也有一些优势,因为它通常扩增得更好。

四、笔者观点

在齿形人科和金针菇中都观察到一些系统发育亚结构,其中亚支是根据宿主物种形成的,这表明物种内也具有一定的宿主特异性。

这是活跃进化辐射的证据,这可能导致物种形成事件,其中一些亚支实际上可能代表亚种水平上的分类学上可分离的实体。因此,这些物种可能是更大规模种群遗传研究的良好候选者,以详细研究宿主特异性、基因流动和物种形成过程。

在他的分类中,来自七叶胭脂红、嵌形胭脂虫,因为分生孢子的大小和形状是物种分类的主要标准,在大多数这些系统发育不同的实体之间是相似的,而分生孢子形态等其他特征是高度可变的,也不适合形态学上的区分。

五、参考文献

【1】Al-Shehbaz IY, Price RA (1998) 金莲属(芸苔科)的划界。新约 8:124-126

【2】Bonants P, van Hagenaar-de Weerdt M, Gent-Pelzer M, Lacourt I, Cooke D, Duncan J (1997) 通过聚合酶链反应检测和鉴定脆弱疫霉希克曼。欧洲植物病理学杂志103:345-355

【3】Choi YJ, Hong SB, Shin HD (2003) 基于ITS rDNA序列的来自核心芸苔科宿主的透明孢子寄生体复合体的多样性。Mycol Res 107:1313–1321

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