十六世纪法国的宗教改革导致了天主教和胡格诺派新教之间的相互排斥和冲突。为了化解社会动荡，凯瑟琳将女儿玛戈嫁给了纳瓦尔地区的国王亨利。但有条件的政治婚姻使亨利和马戈处于守势。由于玛戈与哥哥安茹有染，自然也引起了因失去情欲而产生的敌意。
事實上，婚禮派對是由凱瑟琳設計的，目的是在亨利帶來數千匹馬的夜晚進行屠殺，幾乎所有馬匹都是在一夜之間被殺死的。但在关键时刻，亨利不得不在马戈的奴役下皈依天主教，让亨利暂时逃脱。
在大屠杀之前，马戈和亨利发生了言语冲突，并出去勾引这个人，所以他们遇到了拉莫勒。在大屠杀期间，拉莫勒遭到科科纳的袭击，逃进了玛戈的卧室，在玛戈的坚持下，他暂时撤退了。
但当拉莫勒逃脱并与科克纳发生争执时，两人几乎被打败，被作为死人送往乱葬坑埋葬，但幸运的是，刽子手发现两人还有呼吸，救了两人。拉莫勒先醒了过来，不仅没有伤害科科纳，反而救了他，科科纳醒来时心存感激，两人成了朋友。
在狩猎日，国王查理九世试图追逐野猪，但反而摔倒并被压在马下，但幸运的是亨利在他的兄弟试图谋杀查理时救了他，查理将亨利带回了房间，并将他的妻子玛丽和儿子介绍给亨利。
凯瑟琳几次试图杀死亨利，但都逃脱了查理的拖延，但查理偶尔会建议亨利如果有机会就逃回纳瓦拉。但亨利坚持要带上玛戈。
凯瑟琳买了一本狩猎书，偷偷地把毒药放在书的书页上，本来是想陷害亨利的，没想到这本书早一步就被查理拿走了。没过多久，查理发现自己中毒了，宫廷香水制造商知道，下毒的人是他的母亲。
亨利在他的保护下迅速返回纳瓦拉，并恢复了对新教的信仰，也鼓舞了纳瓦拉的士气。此时拉莫林对亨利，所以在亨利的指定地点没有退缩到王宫带回玛戈，但不幸的是刚进入城市就被抓住了。
玛戈要求查理大赦，但查理正在与中毒作斗争。查理死后，安茹立即就位，玛戈带着拉莫尔的头颅前往纳瓦拉，与亨利团聚。
《马戈女王》是法国电影史上罕见的作品，面临着人际互动和私人欲望冲突的混合体;导演不得不放弃很多情节点，才能突出镜子的节奏和截止技巧;这也是一些伟大史诗中的常见问题。
好在影片的整体表现并没有落入一般的境地，再加上几位优秀演员的个性，让影片有了另类的光明。虽然人物复杂，并不完全了解法国历史，难免有一种无法接近的感觉，但原则上，在导演有条不紊和渐进的介绍中，这些困境被降到了最低。
马大中原作，当然让玛戈这个角色因为放大了现在令人印象深刻的传奇人物，也因为故事的渲染，让观众对16世纪的法国当代风格有了更好的了解。
通过法国宫廷的夺权和荒凉的混乱，呈现出历史的演变，加上人性的挤压，从而凸显了人性和兽性本性的平行与分裂。从历史上看，兄弟姐妹一直在上升，但不像法国宫廷那样宏伟。
当然，这部电影聚焦于新旧宗教之间的纷争，大屠杀的演变虽然令人震惊，但提供了更多的反思空间。
凯瑟琳王后从意大利嫁给了法国，她有责任巩固自己的天主教地位，但真正的原因是要站在制高点上，总是对政治变革持谨慎态度。为了消除这种恐慌，只有通过中毒，即控制动乱。毫不奇怪，她的女儿已经成为她的棋子之一。
婚礼现场华丽而庄严，但当查理九世压住妹妹的头说"她会"时，所有的表象都瞬间瓦解了。不僅如此，幾個王子和兄弟在婚禮上互相嘲笑，只是嫉妒他們和妹妹睡了覺。
看似荒谬的世界无法直面真爱的当下。玛戈在新婚之夜戴上面具，在法庭外寻求性刺激和慰藉，却没想到会点燃她和拉莫尔之间的真实关系。从性与爱情，虽然与传统相反，但对交换真爱没有害处。
大屠杀当晚，受伤的拉莫伊尔逃进了马戈的卧室，马戈冒着生命危险救了他，但也拉开了拉莫尔与一直在追赶他的科科纳的未来友谊。
玛戈和丈夫亨利是妥协的婚姻，但潜意识里也有一定程度的婚姻认同，否则亨利不会被当面警告不止一次，希望他有机会尽快逃脱。亨利与玛戈哥哥的几次争吵当然是潜意识的同理心。他其实也爱玛戈，马戈自然有一定程度的认可，否则他就不会和亨利上床了。
当宗教蔓延到床上时，这是荒谬和令人不安的，但当时的法国法院对此提出异议。在危机最严重的时候，马戈认为亨利为了皈依天主教而放弃了新教。
在庞大的剧情中，编舞家仍然专注于凯瑟琳企图谋杀亨利的主题，但并不期望错误地杀死查理九。母子俩自相残杀，世上还有什么比这更悲惨的吗？
拉莫勒与玛戈的恋情让他在与亨利对峙时感到内疚，但亨利并不在乎。亨利不爱玛戈，他只是不想表达出来。他告诉查理九世，他想把玛戈带回纳瓦尔，因为这是一个和平宜人的地方，对于一个统治者来说，在表达爱的方面是相当清楚的。
權力和慾望總是緊密追隨著，任何被困在其中的人似乎都難以置身事外，古代和現代的例子非常相似。问题是，身处其中的马戈，似乎就像一个先知，总是知道自己的等级在哪里;无论将来谁上任，马戈都相信，他永远不会被疏远，失去荣耀。
玛戈似乎继承了母亲的血脉，但她有更多的爱去认识和付出，用她年轻的动能支持这个决定。经过一段缓慢的追求，在一种情欲中，必然会发现，背后的真正含义绝对是爱情的渲染。
受伤的拉莫尔躺在玛戈的怀里，摸着她的母爱;从另一个意义上说，马戈的真实身份也来自那场不断变化的大屠杀。
宫廷里几乎每个人都生活在恐怖之中，但他们放弃了自己的王室地位，过着平淡的生活，但没有人对此表示赞同。这是人性的卑鄙见证，我们必须真正面对死亡的威胁，才能理解生命的真谛。
在知道他的母亲在书中毒死了他之后，查理九世没有听从马戈的请求，写下赦免拉莫勒的命令，直到他吞下呼吸时，拉莫勒的头颅掉了下来。
玛戈最终开着马车前往纳瓦拉，说她身上是否有血迹并不重要，因为只要她脸上有笑容。这句话在动荡的背景下是真实而准确的，这是玛戈通常的自我方式。如果他身上有血迹，谁能笑呢？因为没有人是玛戈，只有玛戈有这样的洞察力。
凯瑟琳在戛纳电影节上获得了最佳女主角，但实际上每个角色都非常称职。面对历史的过去，真的有很多思考。