案发现场大雨倾盆，一个女子被铁丝捆在那里，凶手让饿了三天的狗把她活活咬死。现场唯一的线索是一张纸条，上面写着狗食之刑，这个女子是一个爱狗人士，因为男友对狗过敏，所以她把爱狗抛弃了，这也许就是被杀的原因。
当天夜里一个宅男正在玩着游戏，门铃却一直响个不停，出去查看门锁居然自己转动起来，他赶紧拿刀防御。突然一个带着青蛙面具男人出现，直接将他电晕，当他醒来之时面具男出现在眼前。
他整日待在家里也不出去工作，过着啃老族的生活，所以凶手判他有罪，必须承受为母痛苦之刑，最后凶手在他身上割下了和他出生时相同重量的肉。作为惩罚现场也留下了一个纸条，为母之痛。
这两个案子的凶手都是在下雨天作案，警察正在分析案情的时候，一个助理急忙跑过来，他发现了两个案子的共同之处，死者都是三年前一个案子的陪审员，当年的凶手有着精神疾病，他把一个女孩用树脂做成了标本，当众展示被抓后对此供认不讳，就在判处死刑的时候，凶手突然发病，刚刚送到医院就上吊自杀了。
听到这里泽村久志却慌了起来，他的老婆泽村遥就是当年的陪审员，然而他却打不通泽村遥的电话，原来泽村久志整日忙于工作，疏忽了对家庭的照顾，所以泽村遥生气带着孩子离家出走了。
就在泽村久志不知如何是好的时候，又一个案子发生，当年的法官身体被分成两半，一个送到老婆家中，一个送到了外面情妇那里，纸条上面写着平分爱之刑，至此警方对这个案子高度重视。
凶手杀害的都是当年的陪审员，所以马上派人去保护他们，然而还是晚了一步，一女陪审员死在了冰库之内，纸条上写着永远美丽之刑。另一个男陪审员嘴里塞满了针，纸条上写着吞千针之刑。
事到如今陪审员只剩下了泽村遥，事关紧急泽村久志必须在凶手之前找到泽村遥，可是因为涉及亲人他不能调查此案。于是他找到泽村遥的闺蜜秋山佳代，想要得知泽村遥的下落，然而闺蜜也非常讨厌泽村久志并不想告诉他。
与此同时，警察找到闺蜜家中，开门的却是闺蜜男友，他告诉警察闺蜜没有在家此时正在上班，警察来到闺蜜上班的地方，正好碰到泽村久志和闺蜜。在得知会有危险的时候，闺蜜说出泽村遥就在自己家中，可是警察说她家有男友的时候，闺蜜却说她根本没有男友。
那么泽村遥可能会有危险，刚刚开门的人应该就是凶手，他们立刻赶往闺蜜家中，然而还是晚了一步，凶手已经带着泽村遥离开，途中他们和凶手的车辆相遇，泽村久志察觉不对于是开车追赶，在一场追逐大战之后，泽村久志不幸翻车倒地因此凶手逃之夭夭。
第二天餐厅之内，泽村久志和助理正在分析案情的时候，凶手在外面突然出现，泽村久志赶紧跑出去一路追赶，结果却被车子撞倒，眼看凶手就要离开助理只好先去追赶，没过一会泽村久志接到凶手电话，让他来天台见面。
泽村久志来到天台发现助理已被劫持，这时凶手对泽村久志说道当年的案子明明是自己的杰作，那个法官和陪审员却判给了那个精神病人，这对我是一个艺术家太不尊重了，所以要让他们全都成为我的作品。
此时太阳正好出来，凶手看了下太阳随后抓了下脖子，直接把助理推到了楼下，泽村久志上前救助助理，凶手则大摇大摆地再次消失，只留下了悲痛欲绝的泽村久志。
因为助理的事情泽村久志被上级抓走调查，可在途中泽村久志直接跳车逃离，事后泽村久志回想凶手在阳光下抓脖子，可能是得了害怕阳光的皮肤病。于是他走访了所有医院，然而都没有这样的患者，最后在一家研究中心找到了一个女博士，通过拿枪威胁，得知了一个叫雾岛早苗的男人患有这种怪病。
泽村久志来到雾岛早苗家中，眼前的一切让泽村久志震惊，就在此时凶手突然出现一阵激烈的打斗之后，泽村久志不幸被凶手打晕。当泽村久志醒来，他出现在一个密室，里面放着自己妻子泽村遥和儿子一模一样的人偶，孩子手里还抱着一个盒子，泽村久志打开盒子里面有一堆拼图，还有一段录音，只要弄好了拼图，就可以得到出去的密码。
彼时的泽村久志已经崩溃，直接把拼图打翻，然而凶手却在喝着饮料一直监视泽村久志，看着泽村久志崩溃的样子，凶手显得非常开心。不知过了多久泽村久志情绪平复，他发现了一把手枪，难道凶手的意思就是要么让他自杀要么弄好拼图，很显然泽村久志选择了拼图。
在这途中凶手通过管道给泽村久志送去食物，同时还给泽村久志洗脑说是他杀死的泽村遥，由于他的不顾家庭日复一日年复一年，所以他慢慢的把泽村遥折磨杀死。
听到此时泽村久志陷入回忆，他的父亲也是一个警察，每天忙于工作，连母亲的最后一面都没见到，泽村久志因此痛恨父亲。然而没过多久，父亲为了救助一对母女，不幸被歹徒杀害，他的心里非常痛恨歹徒，所以他也成了一名警察。
然而他却没想到，自己也成了一个不顾家的男人，同时另一边警察跟随泽村久志的步伐，找到了那个女博士，然而女博士却对此有所隐瞒。不过一个老警察想起了多年前的一个案子，女博士橘干绘和弟弟小的时候父母被人杀害，他的弟弟雾岛早苗就是患有那种怪病。
与此同时泽村久志也做好了拼图，原来是他儿子画的一幅画，缺失的部分密码就是吃饭的意思，再看看地上的食物，泽村久志好像明白了什么，通过密码出去这是一个厨房，泽村久志打开了一个橱柜，顿时愣在那里，两个人头赫然出现，此刻的心情真的无法形容。
就在此时凶手突然出现，崩溃的泽村久志一路追赶，终于追到了凶手，就在开枪的时候，却发现这个凶手有些不对，泽村久志上前查看却发现是老婆泽村遥。原来刚才那两个人头是凶手用橡胶制作的，这个时候凶手带着泽村久志的儿子出现，开始介绍这个伟大作品，老婆儿子你只能选择一个。
途中双方相互开枪泽村久志重伤倒地，凶手只是肩膀中枪，就在要杀死泽村久志一家的时候，警察突然赶来，凶手被逼的只能冲到了外面，最后在阳光的暴晒之下晕了过去。
三个月后，女博士悄悄来到医院，看着痛苦的弟弟说了这样一番话，你小的时候因为目睹了父母被杀，所以产生了心理阴影，致使自己害怕阳光，要想痊愈就要直面内心的恶意，最后女博士送了弟弟一程。
而另一边泽村久志终于知道了家庭的重要性，一家三口过上了开心的生活，然而泽村久志却发现，儿子一直在不停地抓着脖子。故事到这里就结束了，那么泽村久志的儿子，不会因为这件事情得了心理阴影，从此开始惧怕阳光，长大后会不会成为另一个蛙男？
看完恶魔蛙男这部电影想要表达的是不要每天忙于工作，忽视了家人，不要每日虚度光阴无所事事，对于孩子要有一个美好的童年，这个是非常重要的事情。