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输卵管积水患者如无明显症状也无生育要求，可观察随诊，无需治疗，但是如果有生育要求，手术治疗是最佳的选择，传统的手术方式为输卵管伞端造口术或者输卵管开窗术、盆腔粘连松解术。而随着医学技术的发展，辅助生育技术的出现，输卵管根部切断术成为输卵管积水患者更佳的选择。
1、输卵管积水对生育造成危害
（1）不孕。输卵管的正常功能对受孕有着极重要的作用，它可以捕捉从卵巢排到腹腔成熟的卵子，并提供精子上行的通道，使精子在输卵管壶腹与卵子相遇受精。如果输卵管发生积水，精子无法到达与卵子相遇的地方，从而导致无法受孕。
（2）宫外孕。正常情况下，输卵管通过纤毛的摆动及输卵管平滑肌的蠕动，把受精卵输送到宫腔，而当输卵管积水时，受精卵则无法到达宫腔而停留在输卵管等部位生长，形成宫外孕。宫外孕的产生会造成大出血，引发休克甚至危及生命。
2、输卵管积水对胚胎的危害
胚胎着床亦取决于胚胎质量。阻止胚胎发育，其毒性作用与积水量及浓度有关。来自积水的毒性物质在胚胎移植时流入子宫腔，对移入宫腔的胚胎产生毒素作用，影响其发育，减低其着床能力，降低胚胎种植率及妊娠率，增加流产率。
另外在超排卵中B超监测可发现少数积水呈进行性增大，会被误认为发育卵泡，在做试管婴儿时此现象一方面会引起用药误导，导致取卵时成熟卵细胞比率下降。另一方面B超监测下经阴道取卵过程中误穿积水，积水直接污染卵细胞，影响卵细胞受精及受精卵发育。