从努尔哈赤创立八旗制度以来，这个脱胎于女真渔猎方式的军事制度，就留有非常浓重的兵为将有的部落制度残余。努尔哈赤创立的八旗制度，除了努尔哈赤这个毋庸置疑的领导人之外，他麾下的八个旗往往各行其是，旗主在旗内拥有巨大的权力，旗丁在人身关系都依附于旗主。
八旗
八旗之中的每一旗，都相当于旗主的独立王国。努尔哈赤和各旗主的关系，非常类似于民国时期大军阀头子和小军阀头子之间的关系。也因此，从努尔哈赤开始，八旗诸王们的实力与其麾下的八旗军战斗力有直接的关系，同时，随着旗主们的势力膨胀，也屡次发生了旗主威胁皇权的事情。
例如，皇太极死后，掌握着两白旗的多尔衮，甚至差点儿直接坐上了皇位。即便是甚至因为政治妥协，六岁的福临渔翁得利，但是，多尔衮依然以其强横的实力成为清朝的实际统治者。多尔衮死后，被顺治皇帝任命为顾命大臣的鳌拜再次成为威胁皇权的权臣。
要知道，鳌拜当年曾对皇太极忠心耿耿，甚至不惜性命反对多尔衮，支持皇太极一系，然而，当鳌拜掌权后，他却开始趁康熙年幼，欺凌幼主、专权跋扈。
康熙皇帝
从多尔衮到鳌拜，这些凭借麾下八旗强悍的实力，威胁到皇权的举动，给予康熙留下了太深刻的印象。因此，极具眼光的康熙，决定从根本上肢解八旗的旧有势力，彻底根除八旗旗主们对于皇权的威胁。
康熙最先做的，就是肢解议政王大臣会议。议政王大臣会议，是皇太极设立的、由满洲贵族组成的颇具军事民主意味的军事会议，其目的，也有削弱抑制权力过大的各大贝勒的意思。按照皇太极的设想，能够参与议政王会议的成员包括亲王、贝勒、贝子、国公以及八旗固山额真等八旗贵族们。
皇太极也给予这些成员很大的权力，关键时刻，他们甚至能够左右朝堂，面对议政王大臣会议的决议，甚至连皇帝都难以轻易改变，这自然引起了康熙皇帝的极大不满。其实，对于议政王大臣会议，早在尚未入关之前，一直致力于加强皇权的皇太极就开始削弱该会议的权力。
努尔哈赤
但是，由于皇太极去世过早，八旗的旧有势力又过于强大，因此，议政王会议到康熙时期，依然拥有巨大的权力和影响力。与此同时，随着清军入关，曾经统领八旗们的亲王贵族们纷纷去世，这些贵族的继任者们比之乃父乃祖，相差甚远。
例如，康熙平定三藩之乱时，议政王大臣们的表现就令人十分失望。康熙曾在吴三桂等人叛乱时，按照祖制的要求派出了八名宗氏王公大臣充当了领军大将，但是，除了安亲王岳乐屡立战功之外，其他人都表现乏善可陈，甚至屡战屡败。
有了这样的理由，再加上康熙早有打算，因此，康熙开始有计划、有步骤地削弱议政王大臣会议的权利和地位。康熙先是将哥哥福全、弟弟常宁放入了议政王大臣会议之中。而按照八旗祖制，仅是皇帝兄长弟弟的身份，是不足以进入议政王大臣会议行列的，他们必须有足够的战功，但是很显然，福全和常宁是没有的。
皇太极
其次，随着议政王大臣中的亲王被贬斥、夺爵、去世，康熙也不再递补任何一位亲王和郡王。到了康熙统治的后半阶段，也就是康熙36年一直到康熙去世，议政王大臣里面的宗氏最高爵位，居然只有公爵。到康熙王朝末期，甚至连奉国将军这样的低等爵位都开始进入议政处充数。曾经能够左右八旗乃至于女真军事集团战略方向、决定八旗集团前途命运的议政王会议大臣，已经沦为了一个连参谋权利都没有的荣誉会议。
康熙做的第二步，也是直指要害的一步，即开始调换各旗都统。前面我们已经说到，努尔哈赤从创立八旗制度开始，就赋予了八旗旗主很大的权力，在本旗的内部，旗主们不仅仅拥有军事指挥权，同时，他们还拥有行政权和裁判权。该旗的旗丁们除了战时要听从旗主的指挥，在非战时，人身关系也属于旗主，旗丁与旗主的关系，其实就是主仆关系，旗主甚至可以对旗内的旗丁生杀予夺。
这样巨大的权力，正是八旗诸王们敢与汗王乃至于后来的皇帝相抗衡的最大底气。随着康熙权力的逐渐巩固和手段的日渐成熟，康熙对于这些与独立王国无异的旗主自然十分不满。
因此，针对于这一情况，康熙直接釜底抽薪，康熙36年7月，康熙下诏：“嗣后都统、副都统员缺，应于左右翼内，不论旗分补授”。什么意思呢？康熙皇帝直接打破了原来八旗旗主出缺后有本旗内大员补任的规则，开始调令其他旗的大员担任这一旗旗主之职。
例如，正蓝旗满洲都统出缺时，该旗的都统也就是旗主，并没有由正蓝旗出身的人担任，而是由康熙调了一名隶属于正白旗的满洲大员补任。而随后，镶蓝旗满洲都统出缺后，康熙又再次调了一名原隶属于镶红旗的满洲大员补任。也从这时候开始，康熙皇帝成功地剥夺了各旗旗主的旗权和军权。
八旗旗帜
而随着康熙皇帝对于各旗旗主的互调，新上任的旗主虽然依然拥有十分高的政治地位，但是，他对于被调往的旗完全不了解，更没有亲信可以依靠，他的权利保证，只能来自于皇帝，因此，新的旗主只能一方面对于皇帝感恩戴德，另一方面听从皇帝的指挥。
正是靠着这一高超的手段，康熙皇帝彻底将八旗掌握在手中，从此以后，八旗无论是原属于皇帝的上三旗，还是下五旗，都成为皇帝直接掌握的武力，八旗旗主们再无与皇室分庭抗礼的可能。后来，八旗的各旗都统甚至变成了荣誉职位，虽然政治地位依然很高，却并无多少实际权力。
剥夺八旗旗主和诸王的权力，加强皇权的最后一步，康熙用的是重用皇子这一招。堪称雄才大略的皇太极死后，他的长子豪格却未能顺理成章的继位，皇太极打下的权力基础更几乎被多尔衮剥夺一空，如此惨痛的教训，康熙认为，这正是皇太极没有扶持皇子势力所造成的。
八旗兵丁
因此，康熙皇帝从皇长子成年之后，就十分注意重用皇子，给予皇子足够的权利。从他将毫无功绩，庸庸碌碌的哥哥和弟弟封为和硕亲王，到将年仅18岁、刚刚成年的皇长子任命为抚远大将军的副手，再到康熙的每一次重要政治活动，皇子都作为重要成员参与，康熙赋予他儿子们的权力越来越大，皇子们在清廷的权力也越来越膨胀。
到了康熙晚年的时候，随着康熙的一步步扶持和刻意倾斜，他的皇子们在军事、政治上都拥有极大的权力。甚至在朝廷中央，内阁六部和诸王贵族的权利都远不如皇子们的权力。可以说，到康熙晚年时，很少有哪一王朝的皇帝儿子们能拥有如此广泛巨大的权力。
更重要的是，康熙的儿子们是和平时期成长起来的，他们与努尔哈赤的兄弟子侄们在血雨腥风之中成长是完全不同的。这大概也是康熙王朝后期诸王夺权，朝堂一片混乱的原因。
九子夺嫡
康熙利用给予他的儿子们足够的权力，将原属于亲王和八旗贵族们的权利剥夺一空，但是与此同时，由于给予皇子们过于巨大的权力，也造成了各个皇子在专权的同时，也将朝廷弄得乌烟瘴气，大名鼎鼎的九子夺嫡，正是康熙赋予皇子们过多权力造成的直接结局。
不过不得不说，清朝乃至于康熙实在太过幸运，虽然九子夺嫡十分残酷，朝堂也被弄得一团糟，但是，胜出的雍正皇帝却十分优秀，雍正不但彻底扭转了康熙王朝后期朝堂混乱的局面，也从根本上稳定和巩固了清朝对全国的统治。
当然，也靠着康熙皇帝彻底剥夺八旗旧势力的权力，从康熙之后，清朝的各个皇帝，再没有受过八旗权臣专权之苦。康熙皇帝确实在根本上彻底肢解了八旗旧势力的权力，瓦解了八旗旗主专权的可能。