在晚清时期发生过一次历史上少有的“集体抗旨”事件，那就是著名的“东南互保”。1900年义和团运动期间，八国联军发动侵华战争。气急败坏的慈禧听闻洋人要杀入北京将她赶下台，于是下了一个对十一国宣战的诏书（如今网上喜欢说是向全世界宣战）。而此时在东南担任督抚的李鸿章、刘坤一、张之洞等人联合东南地区的各地督抚一同发起“东南互保”，声称慈禧下的诏书是“乱命”拒不执行。由此八国联军与义和团的战争主要被控制在河北、天津和北京一带，没有蔓延至全国（或者说没有蔓延至南方各省）。
抗旨换来加官进爵
“东南互保”时期，东南各省的总督和巡抚们联合抗旨。这在其他王朝时期可以说是无论如何也要被追究的重罪。结果羸弱的清政府不仅不能将这些“抗旨”的督抚们问罪，反而在事后对这些督抚们加官进爵。
在八国联军攻破北京，慈禧太后和光绪皇帝狼狈逃往西安的路上，慈禧就已经开始抛弃义和团和守旧派的大臣，开始向东南的督抚们示好。到了签订辛丑条约，慈禧和光绪返回北京后，更是开始对参与东南互保的督抚们进行了大肆封赏。似乎这些督抚们不是大逆不道的“抗旨”，倒像是他们集体奉诏勤王救驾一般。
参与东南互保的督抚们的结局
参与东南互保的基本都是湘淮两系的汉族官僚。其中的主要代表是刘坤一、张之洞、李鸿章和盛宣怀等4人，参与其中的还有袁世凯、许应骙等5人。而端方、奎俊等人虽没有参与，但是也支持东南互保。
在主要代表中，刘坤一、张之洞和李鸿章分别担任两江总督、湖广总督和两广总督。在八国联军攻入北京之后，李鸿章被委以全权与联军议和谈判，并在签订《辛丑条约》不久之后病逝，清政府追封他一等侯爵。而刘坤一和张之洞则留任原职，1902年，刘坤一病死在任上。张之洞则成为此后清政府内部权势最显赫的封疆大吏，直到慈禧病死前入京，在清朝灭亡前夕病逝在体仁阁大学士的任上。而在东南互保中四处联络督抚的邮政大臣盛宣怀在事件平息后，也一路高升，被赏太子少保衔，并官至邮传部大臣。在武昌起义爆发后，因为盛宣怀镇压“保路运动”的政策被清政府革职。
在参与“东南互保”的督抚们中，时任山东巡抚的袁世凯因为年轻且富有才干。更重要的是掌握了武卫军的最后力量，使他很快成为晚清最具权势的大臣，最终在辛亥革命中逼迫清帝退位。而担任广东巡抚的德寿则是参与东南互保的唯一一位满族官员，他在李鸿章北上谈判议和时代理两广总督，后来在1902年病逝在漕运总督的任上。担任闽浙总督许应骙则没有那么幸运了，他在1902年因为御史弹劾执政福建浙江的弊政被开缺回籍，第二年病死在家中。而时任安徽巡抚的王之春在后来调任广西巡抚，在1903年，因为预借法军镇压起义从而激起民愤被解职。而最惨的是担任浙江巡抚的刘树棠，他在东南互保时犹豫不决，导致浙江的民团与洋人的冲突激化，最终被清政府抛弃，反而因为保护洋人不力被革职。他也是唯一一个参与了东南互保而被问罪的地方督抚。
而端方和奎俊当时分别是代理陕西巡抚和四川总督。两人虽然没有参与东南互保，但也是公开支持的。在后来两人都继续平步青云，奎俊从地方督抚转任中央大员，先后担任刑部、吏部尚书，后来还担任内务府大臣。在清帝退位后，被袁世凯的北洋政府解职。而端方则先后在湖广、闽浙、两江和直隶等地任职，在武昌起义前夕，受命镇压四川的保路运动，最终被哗变的新军所杀。
综上，参与和支持东南互保的督抚们除了犹豫不决，首鼠两端的浙江巡抚刘树棠基本都没有受到追究。后来因为其他原因有几个也被解职，但大都与东南互保没有直接关系。
公然抗旨为何清政府无力追究
东南互保中，这些地方督抚公然抗旨，这在中国的封建王朝中是非常罕见的。至少在清王朝的历史上是独有的。而作为清朝政府的实际掌权人慈禧为何无力追究，反而要公开承认东南互保的合法性呢？
清政府的实力太弱：在东南互保时期，慈禧领导的清政府除了大义名分，估计在经济、政治和军事任何方面都无法和这些地方督抚抗衡。首先在经济上刚才已经提到，这些督抚控制的地盘是清王朝最富庶的地区。其次在政治上，在镇压完太平天国之后，地方督抚尤其是东南地区的督抚基本上就是汉族官僚把持，尤其是湘系和淮系两大势力在东南各地盘根错节，甚至在中央因为李鸿章等人的缘故，汉族官僚的地位也大大提升。最后在军事上就更加明显，从镇压太平天国起义开始，清政府的国防军就基本被从东南走出的湘军和淮军取代，这些军队就是李鸿章、刘坤一等人带出来的，清政府还真不一定能完全控制这些军队。虽然甲午战争的失败，淮军系统遭受重挫，而清政府也建立起了一支直属的常备军——武卫军，但是八国联军入侵一役，武卫军几乎全军覆没，只有袁世凯的武卫右军因为被他带到了山东参与了东南互保成为仅存的一支。而慈禧倒头来发现她从西安返回北京都需要参与东南互保的袁世凯保护。
综上所述，在东南互保时期，清政府充分暴露了它的羸弱，与“坐拥东南”的地方督抚们相比，慈禧根本没有办法追究他们，所以她不得不公开承认东南互保的合法性，避免这些东南督抚们脱离清政府独立。