赶走了喜克索斯人，雅赫摩斯在底比斯建立起第18王朝，从此开始了埃及的新王国时期(第18一第20王朝)。
这一时代的埃及，国王发动了空前规模的对外战争。埃及版图最大时，北至叙利亚的卡赫美什，南至尼罗河第四瀑布，形成了强大的军事霸国，两河流域与小亚细亚的一些国家，都对埃及俯首称臣。在频繁的对外远征中，埃及的王公费族大肆劫掠财富、牲裔、奴隶等战利品。就连埃及的自由民牧人也都拥有奴隶，而且出现了租赁奴隶。
此时，君主专制的中央集权制度得到加强，法老已成为国王的正式头桁。为了宣扬自己是神的儿子，法老们特别尊重神，神庙和条司也受到优待。新王国时期，阿蒙神被尊为众神之首，地位超过了以往的太阳神，阿蒙神庙的祭司们，由此获取了巨大的利益。随着神庙的影响越来越大，法老们渐渐觉得，自己的统治受到了威胁。
埃赫那吞(约公元前1379年~公元前1362年在位)，是古埃及第18王朝的国王，原名阿蒙霍特普四世。在阿蒙霍特普四世成为法老之前，他对阿蒙神庙的僧侣们互相抱团的作法很不满，听说僧侣们在地方上十分野横后，便决心削减阿蒙神庙的僧侣势力。
阿蒙霍特普四世即位后，启用了一批新的大臣，使他们成为自己政权的支柱。阿蒙霍特普四世下令，在全国范围内恢复对太阳神的崇拜，封闭阿蒙神庙。不仅如此，阿蒙霍特普四世还将自己名字中的“阿蒙”改为“阿吞”，更名为“埃赫那吞”，意为“对阿吞有用的人”。为了扩大声势，埃赫那昋召集了大批文人，创作了许多歌颂太阳神的诗歌，还编写了颂扬阿春功绩的文章，叫人四处传播。
虽然有了一个主神太阳神，但埃及各地还是有五花八门的地方神，一个地方一个样儿，甚至几个样儿。比如一副弓箭，某件木制的雕刻制品，某种石头，都能成为神。至于土地、河流、雨水、泉水、雷电，鸟鲁、昆虫等等，都是埃及人的神或崇拜偶像，简直是无处没有神。
埃赫那吞在全国推行新神取缔旧神的同时，还命令将千百年来古埃及人崇拜的其它的神一扫而光。这措施令习惯阿蒙神和地方神的埃及人十分恐惧，都觉得要大难临头了。僧侣们更是像热锅上的蚂蚁，片刻也不安宁。
已经退位的老法老阿蒙霍特尊三世，害怕因此引起国家的混乱，劝埃赫那吞不要走极端，以免触怒神灵。埃赫那吞没有答应，父子不欢而散。见埃赫那吞闷闷不乐地回来，王后涅菲尔提便问他为什么这样不高兴，埃赫那吞便把老法老劝他的事情说了。涅菲尔提王后对埃赫那吞说：“如果反对的人这样多，我劝陛下还是暂缓行事吧。埃赫那吞说：“僧侣的反对是意料之中的，但对我的行动如此不满却没想到。一旦收回命令，他们自然满意，但我的权威可在天下人面前丢尽了。到时候这些僧侣未必就此罢休，他们一定会蔑视我的懦弱。我现在得到了阿吞神僧侣的赞同，又有军队，也不怕这帮装神弄鬼的人兴风作浪。既然已经得罪他们了，那索性就得罪到底好了。”涅菲尔提见埃赫那吞决心已定，也就不再劝了。
第二天，埃赫那吞颁布了进一步的法令，宣布将阿蒙神庙的僧侣赶出庙门，没收财产。一切公共建筑物和纪念物上的阿蒙的名字必须彻底清除，已没收的神庙土地划归太阳神神庙，并且禁止僧侣参政。首都迁往底比斯以北300公里的希尔摩，新都被命名为“埃赫塔吞”，意为“阿吞的地界"。当天，大批军队查抄了底比斯的各大阿蒙神庙，强行将僧侣们赶出庙门。许多僧侣背着行李卷离开多年生活的庙宇，痛苦不堪，并在心里痛骂埃赫那吞。
迁都后，埃赫那吞沉浸在胜利的喜悦中，整天陶醉在宗教生活和宮廷生活中，政事由麻伊掌管，军事托付给赫伦希布。这俩人因为与阿蒙僧侣有利害冲突，因而很是卖力。可是，阿蒙僧侣们不甘心就此失勢，他们一直在找机会，想刺杀埃赫那吞。
一天，埃赫那吞和母亲同坐一车去祭神。突然马车停了下来，原来是有一个人拦住了车队，说有冤状上告。这人跪行到法老所坐的马车轮下，麻伊从马上俯身去接状纸，这人突然一跃而起，从纸卷中抽出一把锋利的青铜短刀，向车上的法老猛刺过去。就在这千钩一发之际，车右侧的卫土横转过青铜矛，猥狠桶向刺客的后背。刺客未及刺到法老，便沉重地倒了下去，恰好压在法老的身上，刀尖几乎碰到法老的鼻子。
法老遇刺的消息很快传开，阿蒙神庙的僧侣们借机放出风来，说这是阿蒙神对法老的一次警告。一时间，全国上下人心惶惶。王后涅菲尔提优心仲仲，劝了埃赫那吞几句，不料埃赫那吞却大发脾气，将王后斥责了一通。王后十分伤心，带着孩子回到底比斯，直到埃赫那吞死的时候，王后菲尔提也没有原谅他，连葬礼都没参加。
埃赫那吞死后，9岁的吐坦哈吞即位。在阿蒙僧侣势力的压力下，宣布将首都迁回底比斯，为阿蒙神庙僧侣彻底平反，归还庙字财产。
吐坦哈吞在18岁时突然死亡，昔日的臣子麻伊成了法老。由于没有确切的记载，没人知道这期间究竟发生了什么。没过多久，赫伦希布又依仗军队夺取了王位，埃赫塔吞城被宣布为“邪恶的地方”，渐渐变成了一片废墟。