麻省理工的科學家們使用一種簡單的計算機程式設計語言,成功 “黑進”了活體細胞中,并對細胞的功能做出了輕微的修改。有了這樣的基礎,任何人都能輕松地為活體細胞寫入新的功能,從農業到醫藥,都有它的用武之地。
人們可以用計算機程式設計出人造dna,并将其嵌入大腸埃希氏菌中。在特定的條件下,如酸堿度、葡萄糖、光線和溫度等條件發生變化時,電路的開關就會被啟動,并且該過程能夠實作“私人定制”。
合成生物學是一個新的研究領域,即我們可以通過人為的操縱改變微生物的功能,如生産材料、吃掉廢棄物、甚至精确地将藥物送到人體内特定的地點等。
該團隊設計的電路之一包含7個步驟,據稱是目前規模最大的生物電路。改良過的大腸埃希氏菌可以用來治療一些常見疾病,如乳糖不耐症等。
新浪科技訊 中原標準時間4月6日消息,據國外媒體報道,科學家發明了一種足以使合成生物學發生革命性變化的新方法,使得我們對活體細胞的控制能力向前躍進了一大步。隻需使用一種簡單的計算機程式設計語言,科學家就能“黑進”一個活體細胞中,并對細胞的功能做出輕微的修改。
有了這樣的基礎,任何人都能輕松地為活體細胞寫入新的功能,讓它們執行各種各樣的任務。通過改變模仿實體電路的“dna電路”的基因結構,美國的生物工程師們成功地改寫了細菌的“編碼”,根據環境因素改變了它們的功能。
就像編寫計算機軟體一樣,科學家可以使用一種基于文本、并轉移到細胞dna中的程式設計語言,為細胞編入新的功能。“這就像是為細菌設計的程式設計語言,”麻省理工的一名生物工程師克裡斯托弗·沃格特教授(christopher voigt)說道,“你可以先像用計算機程式設計一樣,使用文本語言,然後對其進行編輯,讓文本轉化為放入細胞中的dna序列,電路就可以在細胞内部流通了。”
合成生物學是一個新的研究領域,即我們可以通過人為的操縱改變微生物的功能,如生産材料、吃掉廢棄物、甚至精确地将藥物送到人體内特定的地點等。通過生成dna電路,生物工程師們可以讓細胞按照特定的環境因素,遵循一系列邏輯步驟。
例如,如果周圍的ph值降到了特定水準以下,一個基因開關就會啟動,進而加速某種特定蛋白質的分泌,如胰島素等。運用到實際當中,這意味着隻要增加細胞周邊環境的酸性,就可以促進胰島素的分泌。
麻省理工的研究團隊使用一種名為verilog的程式設計語言,設計了一些邏輯電路,然後使用一種名叫cello的系統,将其編入合成的dna環狀分子(又名質粒)中。接下來,他們利用目前向微生物中添加新基因的技術,将這些人造質粒嵌入到大腸埃希氏菌中。
這一方法非常簡單,即使在基因方面毫無經曆的人也可以設計出人造電路,隻需使用一個負責将計算機代碼轉換成基因功能代碼的網絡程式,就能設計出一個電路,為細胞增添新的功能。
“你可以對它的原理一無所知,但依然能照用不誤,這就是這種方法的特别之處。”沃格特說道,“你可能隻是一名高中生,隻需在網絡伺服器上寫出你想要的程式,它就能自動轉化為dna序列。”
在實驗中,這支麻省理工的研究團隊根據一連串實驗結果,設計出一系列邏輯門,分别通往不同的路徑,并将其成功寫入了dna中,并轉移進了大腸埃希氏菌的細胞裡。
這些電路能夠檢測出不同的成分,如氧氣、葡萄糖,還有光線、溫度、酸堿度及其它環境條件等。此外,這一過程還可以實作“私人訂制”,使用者可以向其中加入其它功能。該團隊設計的電路之一包含7個步驟,據稱是目前規模最大的生物電路。
細胞會同時接收到多個輸入源,是以主要的挑戰在于,設計出的電路在細胞内部不能對彼此造成幹擾。雖然該系統是專為大腸埃希氏菌設計的,但該研究團隊表示,他們正在計劃對使用的程式設計語言稍加改動,好用在其它細菌身上,如在人類内髒中找到的細菌等。
“建造這些電路本來可能要花上很多年工夫。但現在你隻需要按下按鈕,就能立刻得到一段dna序列、并用它進行測試了。”沃格特教授說道。
原文釋出時間為:2016-04-08
本文來自雲栖社群合作夥伴“大資料文摘”,了解相關資訊可以關注“bigdatadigest”微信公衆号